TUB

TUB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1S31
Ідентифікатори
Символи	TUB, rd5, RDOB, tubby bipartite transcription factor, TUB bipartite transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 601197 MGI: 2651573 HomoloGene: 31147 GeneCards: TUB
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • G protein-coupled receptor binding • intraciliary transport particle A binding Клітинна компонента • цитоплазма • extracellular region • гіалоплазма • клітинна мембрана • війка • мембрана • клітинне ядро Біологічний процес • phagocytosis, recognition • receptor localization to non-motile cilium • response to hormone • positive regulation of phagocytosis • photoreceptor cell maintenance • sensory perception of sound • retina development in camera-type eye • protein localization to photoreceptor outer segment • відповідь на стимул • Фагоцитоз • protein localization to cilium • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • intraciliary transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7275	22141
Ensembl	ENSG00000166402	ENSMUSG00000031028
UniProt	P50607	P50586
RefSeq (мРНК)	NM_003320 NM_177972	NM_021885
RefSeq (білок)	NP_003311 NP_813977	NP_068685
Локус (UCSC)	Хр. 11: 8.02 – 8.11 Mb	Хр. 7: 108.55 – 108.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TUB (англ. Tubby bipartite transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 506 амінокислот, а молекулярна маса — 55 651.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSKPHSDWI		PYSVLDDEGR		NLRQQKLDRQ		RALLEQKQKK		KRQEPLMVQA
NADGRPRSRR		ARQSEEQAPL		VESYLSSSGS		TSYQVQEADS		LASVQLGATR
PTAPASAKRT		KAAATAGGQG		GAARKEKKGK		HKGTSGPAAL		AEDKSEAQGP
VQILTVGQSD		HAQDAGETAA		GGGERPSGQD		LRATMQRKGI		SSSMSFDEDE
EDEEENSSSS		SQLNSNTRPS		SATSRKSVRE		AASAPSPTAP		EQPVDVEVQD
LEEFALRPAP		QGITIKCRIT		RDKKGMDRGM		YPTYFLHLDR		EDGKKVFLLA
GRKRKKSKTS		NYLISVDPTD		LSRGGDSYIG		KLRSNLMGTK		FTVYDNGVNP
QKASSSTLES		GTLRQELAAV		CYETNVLGFK		GPRKMSVIVP		GMNMVHERVS
IRPRNEHETL		LARWQNKNTE		SIIELQNKTP		VWNDDTQSYV		LNFHGRVTQA
SVKNFQIIHG		NDPDYIVMQF		GRVAEDVFTM		DYNYPLCALQ		AFAIALSSFD
SKLACE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• North M.A., Naggert J.K., Yan Y., Noben-Trauth K., Nishina P.M. (1997). Molecular characterization of TUB, TULP1, and TULP2, members of the novel tubby gene family and their possible relation to ocular diseases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 3128—3133. PMID 9096357 DOI:10.1073/pnas.94.7.3128
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Caberoy N.B., Maiguel D., Kim Y., Li W. (2010). Identification of tubby and tubby-like protein 1 as eat-me signals by phage display. Exp. Cell Res. 316: 245—257. PMID 19837063 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.10.008

Див. також

• Хромосома 11