TULP3

TULP3
Ідентифікатори
Символи	TULP3, TUBL3, tubby like protein 3, TUB like protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604730 MGI: 1329045 HomoloGene: 20711 GeneCards: TULP3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • enzyme binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • intraciliary transport particle A binding • G protein-coupled receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • intraciliary transport particle A • ciliary base • extracellular region • ядерце • GO:0035085 Аксонема • клітинне ядро • війка • 9+0 non-motile cilium Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of smoothened signaling pathway • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • bronchus morphogenesis • embryonic neurocranium morphogenesis • negative regulation of smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning • embryonic digit morphogenesis • negative regulation of smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord patterning • protein localization to photoreceptor outer segment • limb development • embryonic camera-type eye development • receptor localization to non-motile cilium • multicellular organism development • regulation of smoothened signaling pathway • neural tube closure • brain development • smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning • central nervous system neuron differentiation • neural tube development • ganglion development • dorsal/ventral neural tube patterning • bone development • neural tube formation • anterior/posterior pattern specification • protein localization to cilium Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7289	22158
Ensembl	ENSG00000078246	ENSMUSG00000001521
UniProt	O75386	O88413
RefSeq (мРНК)	NM_003324 NM_001160408	NM_011657
RefSeq (білок)	NP_001153880 NP_003315	NP_035787
Локус (UCSC)	Хр. 12: 2.88 – 2.94 Mb	Хр. 6: 128.32 – 128.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TULP3 (англ. Tubby like protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 442 амінокислот, а молекулярна маса — 49 642.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEASRCRLSP		SGDSVFHEEM		MKMRQAKLDY		QRLLLEKRQR		KKRLEPFMVQ
PNPEARLRRA		KPRASDEQTP		LVNCHTPHSN		VILHGIDGPA		AVLKPDEVHA
PSVSSSVVEE		DAENTVDTAS		KPGLQERLQK		HDISESVNFD		EETDGISQSA
CLERPNSASS		QNSTDTGTSG		SATAAQPADN		LLGDIDDLED		FVYSPAPQGV
TVRCRIIRDK		RGMDRGLFPT		YYMYLEKEEN		QKIFLLAARK		RKKSKTANYL
ISIDPVDLSR		EGESYVGKLR		SNLMGTKFTV		YDRGICPMKG		RGLVGAAHTR
QELAAISYET		NVLGFKGPRK		MSVIIPGMTL		NHKQIPYQPQ		NNHDSLLSRW
QNRTMENLVE		LHNKAPVWNS		DTQSYVLNFR		GRVTQASVKN		FQIVHKNDPD
YIVMQFGRVA		DDVFTLDYNY		PLCAVQAFGI		GLSSFDSKLA		CE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних відростках, війках. Також секретований назовні.

Література

• Nishina P.M., North M.A., Ikeda A., Yan Y., Naggert J.K. (1998). Molecular characterization of a novel tubby gene family member, TULP3, in mouse and humans. Genomics. 54: 215—220. PMID 9828123 DOI:10.1006/geno.1998.5567
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12