U2SURP

U2SURP
Ідентифікатори
Символи	U2SURP, SR140, fSAPa, U2 snRNP associated SURP domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 617849 MGI: 1915208 HomoloGene: 13964 GeneCards: U2SURP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23350	67958
Ensembl	ENSG00000163714	ENSMUSG00000032407
UniProt	O15042	Q6NV83
RefSeq (мРНК)	NM_001080415 NM_001320219 NM_001320220 NM_001320222	NM_001114977 NM_026476 NM_001357974 NM_001357976 NM_001357977 NM_001357975
RefSeq (білок)	NP_001073884 NP_001307148 NP_001307149 NP_001307151	NP_001108449 NP_080752 NP_001344903 NP_001344905 NP_001344906 NP_001344904
Локус (UCSC)	Хр. 3: 142.96 – 143.06 Mb	Хр. 9: 95.34 – 95.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

U2SURP (англ. U2 snRNP associated SURP domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 029 амінокислот, а молекулярна маса — 118 292.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADKTPGGSQ		KASSKTRSSD		VHSSGSSDAH		MDASGPSDSD		MPSRTRPKSP
RKHNYRNESA		RESLCDSPHQ		NLSRPLLENK		LKAFSIGKMS		TAKRTLSKKE
QEELKKKEDE		KAAAEIYEEF		LAAFEGSDGN		KVKTFVRGGV		VNAAKEEHET
DEKRGKIYKP		SSRFADQKNP		PNQSSNERPP		SLLVIETKKP		PLKKGEKEKK
KSNLELFKEE		LKQIQEERDE		RHKTKGRLSR		FEPPQSDSDG		QRRSMDAPSR
RNRSSGVLDD		YAPGSHDVGD		PSTTNLYLGN		INPQMNEEML		CQEFGRFGPL
ASVKIMWPRT		DEERARERNC		GFVAFMNRRD		AERALKNLNG		KMIMSFEMKL
GWGKAVPIPP		HPIYIPPSMM		EHTLPPPPSG		LPFNAQPRER		LKNPNAPMLP
PPKNKEDFEK		TLSQAIVKVV		IPTERNLLAL		IHRMIEFVVR		EGPMFEAMIM
NREINNPMFR		FLFENQTPAH		VYYRWKLYSI		LQGDSPTKWR		TEDFRMFKNG
SFWRPPPLNP		YLHGMSEEQE		TEAFVEEPSK		KGALKEEQRD		KLEEILRGLT
PRKNDIGDAM		VFCLNNAEAA		EEIVDCITES		LSILKTPLPK		KIARLYLVSD
VLYNSSAKVA		NASYYRKFFE		TKLCQIFSDL		NATYRTIQGH		LQSENFKQRV
MTCFRAWEDW		AIYPEPFLIK		LQNIFLGLVN		IIEEKETEDV		PDDLDGAPIE
EELDGAPLED		VDGIPIDATP		IDDLDGVPIK		SLDDDLDGVP		LDATEDSKKN
EPIFKVAPSK		WEAVDESELE		AQAVTTSKWE		LFDQHEESEE		EENQNQEEES
EDEEDTQSSK		SEEHHLYSNP		IKEEMTESKF		SKYSEMSEEK		RAKLREIELK
VMKFQDELES		GKRPKKPGQS		FQEQVEHYRD		KLLQREKEKE		LERERERDKK
DKEKLESRSK		DKKEKDECTP		TRKERKRRHS		TSPSPSRSSS		GRRVKSPSPK
SERSERSERS		HKESSRSRSS		HKDSPRDVSK		KAKRSPSGSR		TPKRSRRSRS
RSPKKSGKKS		RSQSRSPHRS		HKKSKKNKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gilmore-Hebert M., Ramabhadran R., Stern D.F. (2010). Interactions of ErbB4 and Kap1 connect the growth factor and DNA damage response pathways. Mol. Cancer Res. 8: 1388—1398. PMID 20858735 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-10-0042

Див. також

• Хромосома 3