UBE2D1

UBE2D1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2C4P, 2YHO, 3OJ4, 3PTF, 4AP4, 4QPL, 5FER
Ідентифікатори
Символи	UBE2D1, E2(17)KB1, SFT, UBC4/5, UBCH5, UBCH5A, ubiquitin conjugating enzyme E2 D1
Зовнішні ІД	OMIM: 602961 MGI: 2384911 HomoloGene: 20714 GeneCards: UBE2D1
шифр КФ	2.3.2.24
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ubiquitin conjugating enzyme activity • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • цитоплазма • Нуклеоплазма • гіалоплазма • ubiquitin ligase complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • protein K48-linked ubiquitination • BMP signaling pathway • protein polyubiquitination • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • positive regulation of protein ubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • protein deubiquitination • positive regulation of protein polyubiquitination • protein targeting to peroxisome • regulation of mitotic cell cycle phase transition • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7321	216080
Ensembl	ENSG00000072401	ENSMUSG00000019927
UniProt	P51668	P61080
RefSeq (мРНК)	NM_003338 NM_001204880	NM_145420
RefSeq (білок)	NP_001191809 NP_003329	NP_663395
Локус (UCSC)	Хр. 10: 58.33 – 58.37 Mb	Хр. 10: 71.09 – 71.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBE2D1 (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 D1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 147 амінокислот, а молекулярна маса — 16 602.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALKRIQKEL		SDLQRDPPAH		CSAGPVGDDL		FHWQATIMGP		PDSAYQGGVF
FLTVHFPTDY		PFKPPKIAFT		TKIYHPNINS		NGSICLDILR		SQWSPALTVS
KVLLSICSLL		CDPNPDDPLV		PDIAQIYKSD		KEKYNRHARE		WTQKYAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Scheffner M., Huibregtse J.M., Howley P.M. (1994). Identification of a human ubiquitin-conjugating enzyme that mediates the E6-AP-dependent ubiquitination of p53. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 8797—8801. PMID 8090726 DOI:10.1073/pnas.91.19.8797
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gutierrez J.A., Yu J., Rivera S., Wessling-Resnick M. (1997). Functional expression cloning and characterization of SFT, a stimulator of Fe transport. J. Cell Biol. 139: 895—905. PMID 9362508 DOI:10.1083/jcb.139.4.895
• Matsuzawa S., Reed J.C. (2001). Siah-1, SIP, and Ebi collaborate in a novel pathway for beta-catenin degradation linked to p53 responses. Mol. Cell. 7: 915—926. PMID 11389839 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00242-8
• Windheim M., Peggie M., Cohen P. (2008). Two different classes of E2 ubiquitin-conjugating enzymes are required for the mono-ubiquitination of proteins and elongation by polyubiquitin chains with a specific topology. Biochem. J. 409: 723—729. PMID 18042044 DOI:10.1042/BJ20071338
• Zeng W., Xu M., Liu S., Sun L., Chen Z.J. (2009). Key role of Ubc5 and lysine-63 polyubiquitination in viral activation of IRF3. Mol. Cell. 36: 315—325. PMID 19854139 DOI:10.1016/j.molcel.2009.09.037

Див. також

• Хромосома 10