UBE2D2

UBE2D2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UR6, 1W4U, 2CLW, 2ESK, 2ESO, 2ESP, 2ESQ, 3A33, 3JVZ, 3JW0, 3L1Y, 3TGD, 3ZNI, 4A49, 4A4B, 4A4C, 4AUQ, 4DDG, 4LDT, 4V3K, 4V3L, 4WZ3, 5D1L, 5D1K, 5D0M, 5D0K, 5D1M, 5EDV
Ідентифікатори
Символи	UBE2D2, E2(17)KB2, PUBC1, UBC4, UBC4/5, UBCH4, UBCH5B, ubiquitin conjugating enzyme E2 D2
Зовнішні ІД	OMIM: 602962 MGI: 1930715 HomoloGene: 2506 GeneCards: UBE2D2
шифр КФ	2.3.2.24
Пов'язані генетичні захворювання
натуральна віспа
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin conjugating enzyme activity • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • гіалоплазма • ubiquitin ligase complex • нуклеоплазма • екзосома • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • protein K48-linked ubiquitination • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • T cell receptor signaling pathway • protein autoubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • protein targeting to peroxisome • protein K11-linked ubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7322	56550
Ensembl	ENSG00000131508	ENSMUSG00000091896
UniProt	P62837	P62838
RefSeq (мРНК)	NM_003339 NM_181838	NM_019912
RefSeq (білок)	NP_003330 NP_862821	NP_064296
Локус (UCSC)	Хр. 5: 139.53 – 139.63 Mb	Хр. 18: 35.9 – 35.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBE2D2 (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 D2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 147 амінокислот, а молекулярна маса — 16 735.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALKRIHKEL		NDLARDPPAQ		CSAGPVGDDM		FHWQATIMGP		NDSPYQGGVF
FLTIHFPTDY		PFKPPKVAFT		TRIYHPNINS		NGSICLDILR		SQWSPALTIS
KVLLSICSLL		CDPNPDDPLV		PEIARIYKTD		REKYNRIARE		WTQKYAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• Jensen J.P., Bates P.W., Yang M., Vierstra R.D., Weissman A.M. (1995). Identification of a family of closely related human ubiquitin conjugating enzymes. J. Biol. Chem. 270: 30408—30414. PMID 8530467 DOI:10.1074/jbc.270.51.30408
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yu P., Chen Y., Tagle D.A., Cai T. (2002). PJA1, encoding a RING-H2 finger ubiquitin ligase, is a novel human X chromosome gene abundantly expressed in brain. Genomics. 79: 869—874. PMID 12036302 DOI:10.1006/geno.2002.6770
• Windheim M., Peggie M., Cohen P. (2008). Two different classes of E2 ubiquitin-conjugating enzymes are required for the mono-ubiquitination of proteins and elongation by polyubiquitin chains with a specific topology. Biochem. J. 409: 723—729. PMID 18042044 DOI:10.1042/BJ20071338
• Chiang M.H., Chen L.F., Chen H. (2008). Ubiquitin-conjugating enzyme UBE2D2 is responsible for FBXW2 (F-box and WD repeat domain containing 2)-mediated human GCM1 (glial cell missing homolog 1) ubiquitination and degradation. Biol. Reprod. 79: 914—920. PMID 18703417 DOI:10.1095/biolreprod.108.071407
• Zeng W., Xu M., Liu S., Sun L., Chen Z.J. (2009). Key role of Ubc5 and lysine-63 polyubiquitination in viral activation of IRF3. Mol. Cell. 36: 315—325. PMID 19854139 DOI:10.1016/j.molcel.2009.09.037

Див. також

• Хромосома 5