UBR2

UBR2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3NY2, 3NY3
Ідентифікатори
Символи	UBR2, C6orf133, bA49A4.1, dJ242G1.1, dJ392M17.3, ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 609134 MGI: 1861099 HomoloGene: 26151 GeneCards: UBR2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • leucine binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • Хроматин • клітинне ядро • ubiquitin ligase complex • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • cellular response to leucine • GO:0044257 protein catabolic process • male meiosis I • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the N-end rule pathway • negative regulation of TOR signaling • histone H2A ubiquitination • protein polyubiquitination • reciprocal meiotic recombination • male meiotic nuclear division • Сперматогенез • negative regulation of transposition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23304	224826
Ensembl	ENSG00000024048	ENSMUSG00000023977
UniProt	Q8IWV8	Q6WKZ8
RefSeq (мРНК)	NM_001184801 NM_015255 NM_001363705	NM_001177374 NM_146078
RefSeq (білок)	NP_001171730 NP_056070 NP_001350634	NP_001170845 NP_666190
Локус (UCSC)	Хр. 6: 42.56 – 42.69 Mb	Хр. 17: 47.24 – 47.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBR2 (англ. Ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 755 амінокислот, а молекулярна маса — 200 538.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASELEPEVQ		AIDRSLLECS		AEEIAGKWLQ		ATDLTREVYQ		HLAHYVPKIY
CRGPNPFPQK		EDMLAQHVLL		GPMEWYLCGE		DPAFGFPKLE		QANKPSHLCG
RVFKVGEPTY		SCRDCAVDPT		CVLCMECFLG		SIHRDHRYRM		TTSGGGGFCD
CGDTEAWKEG		PYCQKHELNT		SEIEEEEDPL		VHLSEDVIAR		TYNIFAITFR
YAVEILTWEK		ESELPADLEM		VEKSDTYYCM		LFNDEVHTYE		QVIYTLQKAV
NCTQKEAIGF		ATTVDRDGRR		SVRYGDFQYC		EQAKSVIVRN		TSRQTKPLKV
QVMHSSIVAH		QNFGLKLLSW		LGSIIGYSDG		LRRILCQVGL		QEGPDGENSS
LVDRLMLSDS		KLWKGARSVY		HQLFMSSLLM		DLKYKKLFAV		RFAKNYQQLQ
RDFMEDDHER		AVSVTALSVQ		FFTAPTLARM		LITEENLMSI		IIKTFMDHLR
HRDAQGRFQF		ERYTALQAFK		FRRVQSLILD		LKYVLISKPT		EWSDELRQKF
LEGFDAFLEL		LKCMQGMDPI		TRQVGQHIEM		EPEWEAAFTL		QMKLTHVISM
MQDWCASDEK		VLIEAYKKCL		AVLMQCHGGY		TDGEQPITLS		ICGHSVETIR
YCVSQEKVSI		HLPVSRLLAG		LHVLLSKSEV		AYKFPELLPL		SELSPPMLIE
HPLRCLVLCA		QVHAGMWRRN		GFSLVNQIYY		YHNVKCRREM		FDKDVVMLQT
GVSMMDPNHF		LMIMLSRFEL		YQIFSTPDYG		KRFSSEITHK		DVVQQNNTLI
EEMLYLIIML		VGERFSPGVG		QVNATDEIKR		EIIHQLSIKP		MAHSELVKSL
PEDENKETGM		ESVIEAVAHF		KKPGLTGRGM		YELKPECAKE		FNLYFYHFSR
AEQSKAEEAQ		RKLKRQNRED		TALPPPVLPP		FCPLFASLVN		ILQSDVMLCI
MGTILQWAVE		HNGYAWSESM		LQRVLHLIGM		ALQEEKQHLE		NVTEEHVVTF
TFTQKISKPG		EAPKNSPSIL		AMLETLQNAP		YLEVHKDMIR		WILKTFNAVK
KMRESSPTSP		VAETEGTIME		ESSRDKDKAE		RKRKAEIARL		RREKIMAQMS
EMQRHFIDEN		KELFQQTLEL		DASTSAVLDH		SPVASDMTLT		ALGPAQTQVP
EQRQFVTCIL		CQEEQEVKVE		SRAMVLAAFV		QRSTVLSKNR		SKFIQDPEKY
DPLFMHPDLS		CGTHTSSCGH		IMHAHCWQRY		FDSVQAKEQR		RQQRLRLHTS
YDVENGEFLC		PLCECLSNTV		IPLLLPPRNI		FNNRLNFSDQ		PNLTQWIRTI
SQQIKALQFL		RKEESTPNNA		STKNSENVDE		LQLPEGFRPD		FRPKIPYSES
IKEMLTTFGT		ATYKVGLKVH		PNEEDPRVPI		MCWGSCAYTI		QSIERILSDE
DKPLFGPLPC		RLDDCLRSLT		RFAAAHWTVA		SVSVVQGHFC		KLFASLVPND
SHEELPCILD		IDMFHLLVGL		VLAFPALQCQ		DFSGISLGTG		DLHIFHLVTM
AHIIQILLTS		CTEENGMDQE		NPPCEEESAV		LALYKTLHQY		TGSALKEIPS
GWHLWRSVRA		GIMPFLKCSA		LFFHYLNGVP		SPPDIQVPGT		SHFEHLCSYL
SLPNNLICLF		QENSEIMNSL		IESWCRNSEV		KRYLEGERDA		IRYPRESNKL
INLPEDYSSL		INQASNFSCP		KSGGDKSRAP		TLCLVCGSLL		CSQSYCCQTE
LEGEDVGACT		AHTYSCGSGV		GIFLRVRECQ		VLFLAGKTKG		CFYSPPYLDD
YGETDQGLRR		GNPLHLCKER		FKKIQKLWHQ		HSVTEEIGHA		QEANQTLVGI
DWQHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yin J., Kwon Y.T., Varshavsky A., Wang W. (2004). RECQL4, mutated in the Rothmund-Thomson and RAPADILINO syndromes, interacts with ubiquitin ligases UBR1 and UBR2 of the N-end rule pathway. Hum. Mol. Genet. 13: 2421—2430. PMID 15317757 DOI:10.1093/hmg/ddh269
• Matta-Camacho E., Kozlov G., Li F.F., Gehring K. (2010). Structural basis of substrate recognition and specificity in the N-end rule pathway. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 1182—1187. PMID 20835242 DOI:10.1038/nsmb.1894

Див. також

• Хромосома 6