UBXN6

UBXN6
Ідентифікатори
Символи	UBXN6, UBXD1, UBXDC2, UBX domain protein 6
Зовнішні ІД	OMIM: 611946 MGI: 1913780 HomoloGene: 11538 GeneCards: UBXN6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • екзосома • цитоскелет • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • цитоплазма • extrinsic component of membrane • лізосома • lysosomal membrane • ендосома • гіалоплазма • мембрана • early endosome membrane • late endosome membrane • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • macroautophagy • endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway • ERAD pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80700	66530
Ensembl	ENSG00000167671	ENSMUSG00000019578
UniProt	Q9BZV1	Q99PL6
RefSeq (мРНК)	NM_001171091 NM_025241	NM_024432 NM_001379361 NM_001379362
RefSeq (білок)	NP_001164562 NP_079517	NP_077752 NP_001366290 NP_001366291
Локус (UCSC)	Хр. 19: 4.44 – 4.46 Mb	Хр. 17: 56.37 – 56.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBXN6 (англ. UBX domain protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 49 754.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKKFFQEFKA		DIKFKSAGPG		QKLKESVGEK		AHKEKPNQPA		PRPPRQGPTN
EAQMAAAAAL		ARLEQKQSRA		WGPTSQDTIR		NQVRKELQAE		ATVSGSPEAP
GTNVVSEPRE		EGSAHLAVPG		VYFTCPLTGA		TLRKDQRDAC		IKEAILLHFS
TDPVAASIMK		IYTFNKDQDR		VKLGVDTIAK		YLDNIHLHPE		EEKYRKIKLQ
NKVFQERINC		LEGTHEFFEA		IGFQKVLLPA		QDQEDPEEFY		VLSETTLAQP
QSLERHKEQL		LAAEPVRAKL		DRQRRVFQPS		PLASQFELPG		DFFNLTAEEI
KREQRLRSEA		VERLSVLRTK		AMREKEEQRG		LRKYNYTLLR		VRLPDGCLLQ
GTFYARERLG		AVYGFVREAL		QSDWLPFELL		ASGGQKLSED		ENLALNECGL
VPSALLTFSW		DMAVLEDIKA		AGAEPDSILK		PELLSAIEKL		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• Carim-Todd L., Escarceller M., Estivill X., Sumoy L. (2001). Identification and characterization of UBXD1, a novel UBX domain-containing gene on human chromosome 19p13, and its mouse ortholog. Biochim. Biophys. Acta. 1517: 298—301. PMID 11342112 DOI:10.1016/S0167-4781(00)00248-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zweitzig D.R., Shcherbik N., Haines D.S. (2008). AAA ATPase p97 and adaptor UBXD1 suppress MDM2 ubiquitination and degradation and promote constitutive p53 turnover. Mol. Biol. Cell. 19: 5029—5029. PMID 18768758 DOI:10.1091/mbc.E08-01-0067
• Kern M., Fernandez-Saiz V., Schaefer Z., Buchberger A. (2009). UBXD1 binds p97 through two independent binding sites. Biochem. Biophys. Res. Commun. 380: 303—307. PMID 19174149 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.01.076
• Stapf C., Cartwright E., Bycroft M., Hofmann K., Buchberger A. (2011). The general definition of the p97/valosin-containing protein (VCP)-interacting motif (VIM) delineates a new family of p97 cofactors. J. Biol. Chem. 286: 38670—38678. PMID 21896481 DOI:10.1074/jbc.M111.274472
• Kirchner P., Bug M., Meyer H. (2013). Ubiquitination of the N-terminal region of caveolin-1 regulates endosomal sorting by the VCP/p97 AAA-ATPase. J. Biol. Chem. 288: 7363—7372. PMID 23335559 DOI:10.1074/jbc.M112.429076

Див. також

• Хромосома 19