UFD1

UFD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YUJ, 5C1B
Ідентифікатори
Символи	UFD1, UFD1L, ubiquitin fusion degradation 1 like (yeast), ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601754 MGI: 109353 HomoloGene: 39090 GeneCards: UFD1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0032403 protein-containing complex binding • ATPase binding • K48-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • UFD1-NPL4 complex • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex Біологічний процес • error-free translesion synthesis • skeletal system development • retrograde protein transport, ER to cytosol • ER-associated misfolded protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein deubiquitination • negative regulation of type I interferon production • negative regulation of RIG-I signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7353	22230
Ensembl	ENSG00000070010	ENSMUSG00000005262
UniProt	Q92890	P70362
RefSeq (мРНК)	NM_001035247 NM_005659 NM_001362910	NM_011672
RefSeq (білок)	NP_001030324 NP_005650 NP_001349839	NP_035802
Локус (UCSC)	Хр. 22: 19.45 – 19.48 Mb	Хр. 16: 18.63 – 18.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UFD1 (англ. Ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 307 амінокислот, а молекулярна маса — 34 500.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSFNMFDHP		IPRVFQNRFS		TQYRCFSVSM		LAGPNDRSDV		EKGGKIIMPP
SALDQLSRLN		ITYPMLFKLT		NKNSDRMTHC		GVLEFVADEG		ICYLPHWMMQ
NLLLEEGGLV		QVESVNLQVA		TYSKFQPQSP		DFLDITNPKA		VLENALRNFA
CLTTGDVIAI		NYNEKIYELR		VMETKPDKAV		SIIECDMNVD		FDAPLGYKEP
ERQVQHEEST		EGEADHSGYA		GELGFRAFSG		SGNRLDGKKK		GVEPSPSPIK
PGDIKRGIPN		YEFKLGKITF		IRNSRPLVKK		VEEDEAGGRF		VAFSGEGQSL
RKKGRKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chen M., Gutierrez G.J., Ronai Z.A. (2011). Ubiquitin-recognition protein Ufd1 couples the endoplasmic reticulum (ER) stress response to cell cycle control. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 9119—9124. PMID 21571647 DOI:10.1073/pnas.1100028108

Див. також

• Хромосома 22