UPP1

UPP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EUE, 3EUF, 3NBQ
Ідентифікатори
Символи	UPP1, UDRPASE, UP, UPASE, UPP, uridine phosphorylase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 191730 MGI: 1097668 HomoloGene: 2524 GeneCards: UPP1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • каталітична активність • pentosyltransferase activity • glycosyltransferase activity • uridine phosphorylase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • pyrimidine nucleoside salvage • pyrimidine nucleotide metabolic process • nucleoside metabolic process • uridine metabolic process • nucleotide catabolic process • cellular response to glucose starvation • nucleobase-containing compound metabolic process • pyrimidine nucleoside catabolic process • UMP salvage • uridine catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7378	22271
Ensembl	ENSG00000183696	ENSMUSG00000020407
UniProt	Q16831	P52624
RefSeq (мРНК)	NM_001287426 NM_001287428 NM_001287429 NM_001287430 NM_003364 NM_181597 NM_001362774	NM_001159401 NM_001159402 NM_009477
RefSeq (білок)	NP_001274355 NP_001274357 NP_001274358 NP_001274359 NP_003355 NP_001349703	NP_001152873 NP_001152874 NP_033503
Локус (UCSC)	Хр. 7: 48.09 – 48.11 Mb	Хр. 11: 9.07 – 9.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UPP1 (англ. Uridine phosphorylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 33 934.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAATGANAEK		AESHNDCPVR		LLNPNIAKMK		EDILYHFNLT		TSRHNFPALF
GDVKFVCVGG		SPSRMKAFIR		CVGAELGLDC		PGRDYPNICA		GTDRYAMYKV
GPVLSVSHGM		GIPSISIMLH		ELIKLLYYAR		CSNVTIIRIG		TSGGIGLEPG
TVVITEQAVD		TCFKAEFEQI		VLGKRVIRKT		DLNKKLVQEL		LLCSAELSEF
TTVVGNTMCT		LDFYEGQGRL		DGALCSYTEK		DKQAYLEAAY		AAGVRNIEME
SSVFAAMCSA		CGLQAAVVCV		TLLNRLEGDQ		ISSPRNVLSE		YQQRPQRLVS
YFIKKKLSKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• Watanabe S., Uchida T. (1995). Cloning and expression of human uridine phosphorylase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 216: 265—272. PMID 7488099 DOI:10.1006/bbrc.1995.2619
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Roosild T.P., Castronovo S., Fabbiani M., Pizzorno G. (2009). Implications of the structure of human uridine phosphorylase 1 on the development of novel inhibitors for improving the therapeutic window of fluoropyrimidine chemotherapy. BMC Struct. Biol. 9: 14—14. PMID 19291308 DOI:10.1186/1472-6807-9-14
• Roosild T.P., Castronovo S. (2010). Active site conformational dynamics in human uridine phosphorylase 1. PLoS ONE. 5: E12741—E12741. PMID 20856879 DOI:10.1371/journal.pone.0012741

Див. також

• Хромосома 7