USP10

USP10
Ідентифікатори
Символи	USP10, UBPO, ubiquitin specific peptidase 10
Зовнішні ІД	OMIM: 609818 MGI: 894652 HomoloGene: 31294 GeneCards: USP10
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • transmembrane transporter binding • p53 binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • RNA binding • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • цитоплазма • ендосома • Нуклеоплазма • early endosome • клітинне ядро • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • Автофагія • regulation of autophagy • translesion synthesis • cellular response to interleukin-1 • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9100	22224
Ensembl	ENSG00000103194	ENSMUSG00000031826
UniProt	Q14694	P52479
RefSeq (мРНК)	NM_001272075 NM_005153	NM_009462 NM_001310630
RefSeq (білок)	NP_001259004 NP_005144	NP_001297559 NP_033488
Локус (UCSC)	Хр. 16: 84.7 – 84.78 Mb	Хр. 8: 120.64 – 120.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP10 (англ. Ubiquitin specific peptidase 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 798 амінокислот, а молекулярна маса — 87 134.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALHSPQYIF		GDFSPDEFNQ		FFVTPRSSVE		LPPYSGTVLC		GTQAVDKLPD
GQEYQRIEFG		VDEVIEPSDT		LPRTPSYSIS		STLNPQAPEF		ILGCTASKIT
PDGITKEASY		GSIDCQYPGS		ALALDGSSNV		EAEVLENDGV		SGGLGQRERK
KKKKRPPGYY		SYLKDGGDDS		ISTEALVNGH		ANSAVPNSVS		AEDAEFMGDM
PPSVTPRTCN		SPQNSTDSVS		DIVPDSPFPG		ALGSDTRTAG		QPEGGPGADF
GQSCFPAEAG		RDTLSRTAGA		QPCVGTDTTE		NLGVANGQIL		ESSGEGTATN
GVELHTTESI		DLDPTKPESA		SPPADGTGSA		SGTLPVSQPK		SWASLFHDSK
PSSSSPVAYV		ETKYSPPAIS		PLVSEKQVEV		KEGLVPVSED		PVAIKIAELL
ENVTLIHKPV		SLQPRGLINK		GNWCYINATL		QALVACPPMY		HLMKFIPLYS
KVQRPCTSTP		MIDSFVRLMN		EFTNMPVPPK		PRQALGDKIV		RDIRPGAAFE
PTYIYRLLTV		NKSSLSEKGR		QEDAEEYLGF		ILNGLHEEML		NLKKLLSPSN
EKLTISNGPK		NHSVNEEEQE		EQGEGSEDEW		EQVGPRNKTS		VTRQADFVQT
PITGIFGGHI		RSVVYQQSSK		ESATLQPFFT		LQLDIQSDKI		RTVQDALESL
VARESVQGYT		TKTKQEVEIS		RRVTLEKLPP		VLVLHLKRFV		YEKTGGCQKL
IKNIEYPVDL		EISKELLSPG		VKNKNFKCHR		TYRLFAVVYH		HGNSATGGHY
TTDVFQIGLN		GWLRIDDQTV		KVINQYQVVK		PTAERTAYLL		YYRRVDLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендосомах.

Література

• Soncini C., Berdo I., Draetta G. (2001). Ras-GAP SH3 domain binding protein (G3BP) is a modulator of USP10, a novel human ubiquitin specific protease. Oncogene. 20: 3869—3879. PMID 11439350 DOI:10.1038/sj.onc.1204553
• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
• Bomberger J.M., Barnaby R.L., Stanton B.A. (2009). The deubiquitinating enzyme USP10 regulates the post-endocytic sorting of cystic fibrosis transmembrane conductance regulator in airway epithelial cells. J. Biol. Chem. 284: 18778—18789. PMID 19398555 DOI:10.1074/jbc.M109.001685

Див. також

• Хромосома 16