USP17L2

USP17L2
Ідентифікатори
Символи	USP17L2, DUB-3, DUB3, USP17, ubiquitin specific peptidase 17-like family member 2, ubiquitin specific peptidase 17 like family member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610186 MGI: 107698 HomoloGene: 136557 GeneCards: USP17L2
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of apoptotic process • negative regulation of histone deacetylation • regulation of cell migration • protein K48-linked deubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of defense response to virus by host • mitotic cell cycle checkpoint signaling • протеоліз • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of protein targeting to membrane • positive regulation of RIG-I signaling pathway • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • protein K63-linked deubiquitination • regulation of cell population proliferation • regulation of ruffle assembly • клітинний цикл • negative regulation of protein processing • positive regulation of MDA-5 signaling pathway • CAAX-box protein processing • GO:0097285 апоптоз • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	377630	13532
Ensembl	ENSG00000223443 ENSG00000284990	ENSMUSG00000058976
UniProt	Q6R6M4	G5E8I7
RefSeq (мРНК)	NM_201402	NM_010089
RefSeq (білок)	NP_958804	NP_034219
Локус (UCSC)	Хр. 8: 12.14 – 12.14 Mb	Хр. 7: 103.06 – 103.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP17L2 (англ. Ubiquitin specific peptidase 17-like family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 530 амінокислот, а молекулярна маса — 59 619.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDDSLYLGG		EWQFNHFSKL		TSSRPDAAFA		EIQRTSLPEK		SPLSSEARVD
LCDDLAPVAR		QLAPRKKLPL		SSRRPAAVGA		GLQNMGNTCY		ENASLQCLTY
TPPLANYMLS		REHSQTCQRP		KCCMLCTMQA		HITWALHSPG		HVIQPSQALA
AGFHRGKQED		AHEFLMFTVD		AMKKACLPGH		KQVDHHSKDT		TLIHQIFGGC
WRSQIKCLHC		HGISDTFDPY		LDIALDIQAA		QSVKQALEQL		VKPEELNGEN
AYHCGLCLQR		APASKTLTLH		TSAKVLILVL		KRFSDVTGNK		LAKNVQYPEC
LDMQPYMSQQ		NTGPLVYVLY		AVLVHAGWSC		HDGHYFSYVK		AQEGQWYKMD
DAKVTACSIT		SVLSQQAYVL		FYIQKSEWER		HSESVSRGRE		PRALGAEDTD
RRATQGELKR		DHPCLQAPEL		DERLVERATQ		ESTLDHWKFP		QEQNKTKPEF
NVRKVEGTLP		PNVLVIHQSK		YKCGMKNHHP		EQQSSLLNLS		STTRTDQESV
NTGTLASLQG		RTRRSKGKNK		HSKRALLVCQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинний цикл, убіквітинування білків. Локалізований у ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Burrows J.F., McGrattan M.J., Johnston J.A. (2005). The DUB/USP17 deubiquitinating enzymes, a multigene family within a tandemly repeated sequence. Genomics. 85: 524—529. PMID 15780755 DOI:10.1016/j.ygeno.2004.11.013
• Shin J.-M., Yoo K.-J., Kim M.-S., Kim D., Baek K.-H. (2006). Hyaluronan- and RNA-binding deubiquitinating enzymes of USP17 family members associated with cell viability. BMC Genomics. 7: 292—292. PMID 17109758 DOI:10.1186/1471-2164-7-292
• Burrows J.F., Scott C.J., Johnston J.A. (2010). The DUB/USP17 deubiquitinating enzymes: a gene family within a tandemly repeated sequence, is also embedded within the copy number variable beta-defensin cluster. BMC Genomics. 11: 250—250. PMID 20403174 DOI:10.1186/1471-2164-11-250

Див. також

• Хромосома 8