USP25

USP25
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MUX
Ідентифікатори
Символи	USP25, USP21, ubiquitin specific peptidase 25
Зовнішні ІД	OMIM: 604736 MGI: 1353655 HomoloGene: 8374 GeneCards: USP25
Онтологія гена Молекулярна функція • ATPase binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding • thiol-dependent deubiquitinase • GO:1904454, GO:1904455, GO:0070138 ubiquitin-like protein-specific protease activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • protein K63-linked deubiquitination • protein K48-linked deubiquitination • negative regulation of ERAD pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination • regulation of protein stability Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29761	30940
Ensembl	ENSG00000155313	ENSMUSG00000022867
UniProt	Q9UHP3	P57080
RefSeq (мРНК)	NM_001283041 NM_001283042 NM_013396 NM_001352560 NM_001352561 NM_001388299 NM_001388300 NM_001388301 NM_001388302	NM_013918
RefSeq (білок)	NP_001269970 NP_001269971 NP_037528 NP_001339489 NP_001339490	NP_038946
Локус (UCSC)	Хр. 21: 15.73 – 15.88 Mb	Хр. 16: 76.81 – 76.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP25 (англ. Ubiquitin specific peptidase 25) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 055 амінокислот, а молекулярна маса — 122 218.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTVEQNVLQQ		SAAQKHQQTF		LNQLREITGI		NDTQILQQAL		KDSNGNLELA
VAFLTAKNAK		TPQQEETTYY		QTALPGNDRY		ISVGSQADTN		VIDLTGDDKD
DLQRAIALSL		AESNRAFRET		GITDEEQAIS		RVLEASIAEN		KACLKRTPTE
VWRDSRNPYD		RKRQDKAPVG		LKNVGNTCWF		SAVIQSLFNL		LEFRRLVLNY
KPPSNAQDLP		RNQKEHRNLP		FMRELRYLFA		LLVGTKRKYV		DPSRAVEILK
DAFKSNDSQQ		QDVSEFTHKL		LDWLEDAFQM		KAEEETDEEK		PKNPMVELFY
GRFLAVGVLE		GKKFENTEMF		GQYPLQVNGF		KDLHECLEAA		MIEGEIESLH
SENSGKSGQE		HWFTELPPVL		TFELSRFEFN		QALGRPEKIH		NKLEFPQVLY
LDRYMHRNRE		ITRIKREEIK		RLKDYLTVLQ		QRLERYLSYG		SGPKRFPLVD
VLQYALEFAS		SKPVCTSPVD		DIDASSPPSG		SIPSQTLPST		TEQQGALSSE
LPSTSPSSVA		AISSRSVIHK		PFTQSRIPPD		LPMHPAPRHI		TEEELSVLES
CLHRWRTEIE		NDTRDLQESI		SRIHRTIELM		YSDKSMIQVP		YRLHAVLVHE
GQANAGHYWA		YIFDHRESRW		MKYNDIAVTK		SSWEELVRDS		FGGYRNASAY
CLMYINDKAQ		FLIQEEFNKE		TGQPLVGIET		LPPDLRDFVE		EDNQRFEKEL
EEWDAQLAQK		ALQEKLLASQ		KLRESETSVT		TAQAAGDPEY		LEQPSRSDFS
KHLKEETIQI		ITKASHEHED		KSPETVLQSA		IKLEYARLVK		LAQEDTPPET
DYRLHHVVVY		FIQNQAPKKI		IEKTLLEQFG		DRNLSFDERC		HNIMKVAQAK
LEMIKPEEVN		LEEYEEWHQD		YRKFRETTMY		LIIGLENFQR		ESYIDSLLFL
ICAYQNNKEL		LSKGLYRGHD		EELISHYRRE		CLLKLNEQAA		ELFESGEDRE
VNNGLIIMNE		FIVPFLPLLL		VDEMEEKDIL		AVEDMRNRWC		SYLGQEMEPH
LQEKLTDFLP		KLLDCSMEIK		SFHEPPKLPS		YSTHELCERF		ARIMLSLSRT
PADGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bosch-Comas A., Lindsten K., Gonzalez-Duarte R., Masucci M.G., Marfany G. (2006). The ubiquitin-specific protease USP25 interacts with three sarcomeric proteins. Cell. Mol. Life Sci. 63: 723—734. PMID 16501887 DOI:10.1007/s00018-005-5533-1
• Meulmeester E., Kunze M., Hsiao H.H., Urlaub H., Melchior F. (2008). Mechanism and consequences for paralog-specific sumoylation of ubiquitin-specific protease 25. Mol. Cell. 30: 610—619. PMID 18538659 DOI:10.1016/j.molcel.2008.03.021
• Denuc A., Bosch-Comas A., Gonzalez-Duarte R., Marfany G. (2009). The UBA-UIM domains of the USP25 regulate the enzyme ubiquitination state and modulate substrate recognition. PLoS ONE. 4: E5571—E5571. PMID 19440361 DOI:10.1371/journal.pone.0005571
• Cholay M., Reverdy C., Benarous R., Colland F., Daviet L. (2010). Functional interaction between the ubiquitin-specific protease 25 and the SYK tyrosine kinase. Exp. Cell Res. 316: 667—675. PMID 19909739 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.10.023

Див. також

• Хромосома 21