USP36

USP36
Ідентифікатори
Символи	USP36, DUB1, ubiquitin specific peptidase 36
Зовнішні ІД	OMIM: 612543 MGI: 1919594 HomoloGene: 11828 GeneCards: USP36
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • nuclear speck Біологічний процес • protein deubiquitination • regulation of autophagy of mitochondrion • ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57602	72344
Ensembl	ENSG00000055483	ENSMUSG00000033909
UniProt	Q9P275	B1AQJ2
RefSeq (мРНК)	NM_025090 NM_001321291	NM_001033528
RefSeq (білок)	NP_001308220	NP_001028700
Локус (UCSC)	Хр. 17: 78.79 – 78.84 Mb	Хр. 11: 118.15 – 118.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP36 (англ. Ubiquitin specific peptidase 36) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 121 амінокислот, а молекулярна маса — 122 652.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPIVDKLKEA		LKPGRKDSAD		DGELGKLLAS		SAKKVLLQKI		EFEPASKSFS
YQLEALKSKY		VLLNPKTEGA		SRHKSGDDPP		ARRQGSEHTY		ESCGDGVPAP
QKVLFPTERL		SLRWERVFRV		GAGLHNLGNT		CFLNATIQCL		TYTPPLANYL
LSKEHARSCH		QGSFCMLCVM		QNHIVQAFAN		SGNAIKPVSF		IRDLKKIARH
FRFGNQEDAH		EFLRYTIDAM		QKACLNGCAK		LDRQTQATTL		VHQIFGGYLR
SRVKCSVCKS		VSDTYDPYLD		VALEIRQAAN		IVRALELFVK		ADVLSGENAY
MCAKCKKKVP		ASKRFTIHRT		SNVLTLSLKR		FANFSGGKIT		KDVGYPEFLN
IRPYMSQNNG		DPVMYGLYAV		LVHSGYSCHA		GHYYCYVKAS		NGQWYQMNDS
LVHSSNVKVV		LNQQAYVLFY		LRIPGSKKSP		EGLISRTGSS		SLPGRPSVIP
DHSKKNIGNG		IISSPLTGKR		QDSGTMKKPH		TTEEIGVPIS		RNGSTLGLKS
QNGCIPPKLP		SGSPSPKLSQ		TPTHMPTILD		DPGKKVKKPA		PPQHFSPRTA
QGLPGTSNSN		SSRSGSQRQG		SWDSRDVVLS		TSPKLLATAT		ANGHGLKGND
ESAGLDRRGS		SSSSPEHSAS		SDSTKAPQTP		RSGAAHLCDS		QETNCSTAGH
SKTPPSGADS		KTVKLKSPVL		SNTTTEPAST		MSPPPAKKLA		LSAKKASTLW
RATGNDLRPP		PPSPSSDLTH		PMKTSHPVVA		STWPVHRARA		VSPAPQSSSR
LQPPFSPHPT		LLSSTPKPPG		TSEPRSCSSI		STALPQVNED		LVSLPHQLPE
ASEPPQSPSE		KRKKTFVGEP		QRLGSETRLP		QHIREATAAP		HGKRKRKKKK
RPEDTAASAL		QEGQTQRQPG		SPMYRREGQA		QLPAVRRQED		GTQPQVNGQQ
VGCVTDGHHA		SSRKRRRKGA		EGLGEEGGLH		QDPLRHSCSP		MGDGDPEAME
ESPRKKKKRK		QETQRAVEED		GHLKCPRSAK		PQDAVVPESS		SCAPSANGWC
PGDRMGLSQA		PPVSWNGERE		SDVVQELLKY		SSDKAYGRKV		LTWDGKMSAV
SQDAIEDSRQ		ARTETVVDDW		DEEFDRGKEK		KIKKFKREKR		RNFNAFQKLQ
TRRNFWSVTH		PAKAASLSYR		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17