USP39

USP39
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3JCR
Ідентифікатори
Символи	USP39, 65K, HSPC332, SAD1, SNRNP65, CGI-21, ubiquitin specific peptidase 39
Зовнішні ІД	OMIM: 611594 MGI: 107622 HomoloGene: 13183 GeneCards: USP39
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex Біологічний процес • protein deubiquitination • mRNA splicing, via spliceosome • клітинний цикл • mRNA processing • Сплайсинг РНК • поділ клітини • spliceosomal complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10713	28035
Ensembl	ENSG00000168883	ENSMUSG00000056305
UniProt	Q53GS9	Q3TIX9
RefSeq (мРНК)	NM_001256725 NM_001256726 NM_001256727 NM_001256728 NM_006590	NM_138592
RefSeq (білок)	NP_001243654 NP_001243655 NP_001243656 NP_001243657 NP_006581	NP_613058
Локус (UCSC)	Хр. 2: 85.6 – 85.65 Mb	Хр. 6: 72.3 – 72.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP39 (англ. Ubiquitin specific peptidase 39) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 565 амінокислот, а молекулярна маса — 65 381.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGRSKRESR		GSTRGKRESE		SRGSSGRVKR		ERDREREPEA		ASSRGSPVRV
KREFEPASAR		EAPASVVPFV		RVKREREVDE		DSEPEREVRA		KNGRVDSEDR
RSRHCPYLDT		INRSVLDFDF		EKLCSISLSH		INAYACLVCG		KYFQGRGLKS
HAYIHSVQFS		HHVFLNLHTL		KFYCLPDNYE		IIDSSLEDIT		YVLKPTFTKQ
QIANLDKQAK		LSRAYDGTTY		LPGIVGLNNI		KANDYANAVL		QALSNVPPLR
NYFLEEDNYK		NIKRPPGDIM		FLLVQRFGEL		MRKLWNPRNF		KAHVSPHEML
QAVVLCSKKT		FQITKQGDGV		DFLSWFLNAL		HSALGGTKKK		KKTIVTDVFQ
GSMRIFTKKL		PHPDLPAEEK		EQLLHNDEYQ		ETMVESTFMY		LTLDLPTAPL
YKDEKEQLII		PQVPLFNILA		KFNGITEKEY		KTYKENFLKR		FQLTKLPPYL
IFCIKRFTKN		NFFVEKNPTI		VNFPITNVDL		REYLSEEVQA		VHKNTTYDLI
ANIVHDGKPS		EGSYRIHVLH		HGTGKWYELQ		DLQVTDILPQ		MITLSEAYIQ
IWKRRDNDET		NQQGA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, клітинний цикл, поділ клітини, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Makarova O.V., Makarov E.M., Luehrmann R. (2001). The 65 and 110 kDa SR-related proteins of the U4/U6*U5 tri-snRNP are essential for the assembly of mature spliceosomes. EMBO J. 20: 2553—2563. PMID 11350945 DOI:10.1093/emboj/20.10.2553
• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
• van Leuken R.J., Luna-Vargas M.P., Sixma T.K., Wolthuis R.M., Medema R.H. (2008). Usp39 is essential for mitotic spindle checkpoint integrity and controls mRNA-levels of aurora B. Cell Cycle. 7: 2710—2719. PMID 18728397

Див. також

• Хромосома 2