USP48

USP48
Ідентифікатори
Символи	USP48, RAP1GA1, USP31, ubiquitin specific peptidase 48
Зовнішні ІД	OMIM: 617445 MGI: 2158502 HomoloGene: 12988 GeneCards: USP48
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • мітохондрія • Нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84196	170707
Ensembl	ENSG00000090686	ENSMUSG00000043411
UniProt	Q86UV5	Q3V0C5
RefSeq (мРНК)	NM_001032730 NM_032236 NM_001330394 NM_001350164 NM_001350166 NM_001350167 NM_001350168	NM_130879 NM_001347227 NM_001355588
RefSeq (білок)	NP_001027902 NP_001317323 NP_115612 NP_001337093 NP_001337095 NP_001337096 NP_001337097	NP_001334156 NP_570949 NP_001342517 NP_001392866 NP_001392867 NP_001392868 NP_001392869 NP_001392871 NP_001392872 NP_001392873 NP_001392880 NP_001392881 NP_001392882 NP_001392883 NP_001392884
Локус (UCSC)	Хр. 1: 21.68 – 21.78 Mb	Хр. 4: 137.59 – 137.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP48 (англ. Ubiquitin specific peptidase 48) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 035 амінокислот, а молекулярна маса — 119 032.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPRLQLEKA		AWRWAETVRP		EEVSQEHIET		AYRIWLEPCI		RGVCRRNCKG
NPNCLVGIGE		HIWLGEIDEN		SFHNIDDPNC		ERRKKNSFVG		LTNLGATCYV
NTFLQVWFLN		LELRQALYLC		PSTCSDYMLG		DGIQEEKDYE		PQTICEHLQY
LFALLQNSNR		RYIDPSGFVK		ALGLDTGQQQ		DAQEFSKLFM		SLLEDTLSKQ
KNPDVRNIVQ		QQFCGEYAYV		TVCNQCGRES		KLLSKFYELE		LNIQGHKQLT
DCISEFLKEE		KLEGDNRYFC		ENCQSKQNAT		RKIRLLSLPC		TLNLQLMRFV
FDRQTGHKKK		LNTYIGFSEI		LDMEPYVEHK		GGSYVYELSA		VLIHRGVSAY
SGHYIAHVKD		PQSGEWYKFN		DEDIEKMEGK		KLQLGIEEDL		AEPSKSQTRK
PKCGKGTHCS		RNAYMLVYRL		QTQEKPNTTV		QVPAFLQELV		DRDNSKFEEW
CIEMAEMRKQ		SVDKGKAKHE		EVKELYQRLP		AGAEPYEFVS		LEWLQKWLDE
STPTKPIDNH		ACLCSHDKLH		PDKISIMKRI		SEYAADIFYS		RYGGGPRLTV
KALCKECVVE		RCRILRLKNQ		LNEDYKTVNN		LLKAAVKGSD		GFWVGKSSLR
SWRQLALEQL		DEQDGDAEQS		NGKMNGSTLN		KDESKEERKE		EEELNFNEDI
LCPHGELCIS		ENERRLVSKE		AWSKLQQYFP		KAPEFPSYKE		CCSQCKILER
EGEENEALHK		MIANEQKTSL		PNLFQDKNRP		CLSNWPEDTD		VLYIVSQFFV
EEWRKFVRKP		TRCSPVSSVG		NSALLCPHGG		LMFTFASMTK		EDSKLIALIW
PSEWQMIQKL		FVVDHVIKIT		RIEVGDVNPS		ETQYISEPKL		CPECREGLLC
QQQRDLREYT		QATIYVHKVV		DNKKVMKDSA		PELNVSSSET		EEDKEEAKPD
GEKDPDFNQS		NGGTKRQKIS		HQNYIAYQKQ		VIRRSMRHRK		VRGEKALLVS
ANQTLKELKI		QIMHAFSVAP		FDQNLSIDGK		ILSDDCATLG		TLGVIPESVI
LLKADEPIAD		YAAMDDVMQV		CMPEEGFKGT		GLLGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1