USP49

USP49
Ідентифікатори
Символи	USP49, ubiquitin specific peptidase 49
Зовнішні ІД	MGI: 2685391 HomoloGene: 10235 GeneCards: USP49
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0031493 histone binding • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма Біологічний процес • histone H2B conserved C-terminal lysine deubiquitination • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Сплайсинг РНК • протеоліз • protein deubiquitination • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25862	224836
Ensembl	ENSG00000164663	ENSMUSG00000090115
UniProt	Q70CQ1	Q6P9L4
RefSeq (мРНК)	NM_018561 NM_001286554 NM_001384542	NM_198421
RefSeq (білок)	NP_001273483 NP_061031	NP_940813
Локус (UCSC)	Хр. 6: 41.79 – 41.9 Mb	Хр. 17: 47.94 – 48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP49 (англ. Ubiquitin specific peptidase 49) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 688 амінокислот, а молекулярна маса — 79 198.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDRCKHVGRL		RLAQDHSILN		PQKWCCLECA		TTESVWACLK		CSHVACGRYI
EDHALKHFEE		TGHPLAMEVR		DLYVFCYLCK		DYVLNDNPEG		DLKLLRSSLL
AVRGQKQDTP		VRRGRTLRSM		ASGEDVVLPQ		RAPQGQPQML		TALWYRRQRL
LARTLRLWFE		KSSRGQAKLE		QRRQEEALER		KKEEARRRRR		EVKRRLLEEL
ASTPPRKSAR		LLLHTPRDAG		PAASRPAALP		TSRRVPAATL		KLRRQPAMAP
GVTGLRNLGN		TCYMNSILQV		LSHLQKFREC		FLNLDPSKTE		HLFPKATNGK
TQLSGKPTNS		SATELSLRND		RAEACEREGF		CWNGRASISR		SLELIQNKEP
SSKHISLCRE		LHTLFRVMWS		GKWALVSPFA		MLHSVWSLIP		AFRGYDQQDA
QEFLCELLHK		VQQELESEGT		TRRILIPFSQ		RKLTKQVLKV		VNTIFHGQLL
SQVTCISCNY		KSNTIEPFWD		LSLEFPERYH		CIEKGFVPLN		QTECLLTEML
AKFTETEALE		GRIYACDQCN		SKRRKSNPKP		LVLSEARKQL		MIYRLPQVLR
LHLKRFRWSG		RNHREKIGVH		VVFDQVLTME		PYCCRDMLSS		LDKETFAYDL
SAVVMHHGKG		FGSGHYTAYC		YNTEGGFWVH		CNDSKLNVCS		VEEVCKTQAY
ILFYTQRTVQ		GNARISETHL		QAQVQSSNND		EGRPQTFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, регуляторів хроматину, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6