VAC14

VAC14
Ідентифікатори
Символи	VAC14, ArPIKfyve, TAX1BP2, TRX, Vac14, PIKFYVE complex component, VAC14 component of PIKFYVE complex
Зовнішні ІД	OMIM: 604632 MGI: 2157980 HomoloGene: 6528 GeneCards: VAC14
Пов'язані генетичні захворювання
striatonigral degeneration, childhood-onset; SNDC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • organelle membrane • Golgi membrane • ендосома • early endosome membrane • endosome membrane • PAS complex • ендоплазматичний ретикулум • late endosome membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • extrinsic component of vacuolar membrane Біологічний процес • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • phosphatidylinositol biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55697	234729
Ensembl	ENSG00000103043	ENSMUSG00000010936
UniProt	Q08AM6	Q80WQ2
RefSeq (мРНК)	NM_018052 NM_001351157	NM_146216
RefSeq (білок)	NP_060522 NP_001338086	NP_666328
Локус (UCSC)	Хр. 16: 70.69 – 70.8 Mb	Хр. 8: 111.35 – 111.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VAC14 (англ. Vac14, PIKFYVE complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 782 амінокислот, а молекулярна маса — 87 973.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNPEKDFAPL		TPNIVRALND		KLYEKRKVAA		LEIEKLVREF		VAQNNTVQIK
HVIQTLSQEF		ALSQHPHSRK		GGLIGLAACS		IALGKDSGLY		LKELIEPVLT
CFNDADSRLR		YYACEALYNI		VKVARGAVLP		HFNVLFDGLS		KLAADPDPNV
KSGSELLDRL		LKDIVTESNK		FDLVSFIPLL		RERIYSNNQY		ARQFIISWIL
VLESVPDINL		LDYLPEILDG		LFQILGDNGK		EIRKMCEVVL		GEFLKEIKKN
PSSVKFAEMA		NILVIHCQTT		DDLIQLTAMC		WMREFIQLAG		RVMLPYSSGI
LTAVLPCLAY		DDRKKSIKEV		ANVCNQSLMK		LVTPEDDELD		ELRPGQRQAE
PTPDDALPKQ		EGTASGGPDG		SCDSSFSSGI		SVFTAASTER		APVTLHLDGI
VQVLNCHLSD		TAIGMMTRIA		VLKWLYHLYI		KTPRKMFRHT		DSLFPILLQT
LSDESDEVIL		KDLEVLAEIA		SSPAGQTDDP		GPLDGPDLQA		SHSELQVPTP
GRAGLLNTSG		TKGLECSPST		PTMNSYFYKF		MINLLKRFSS		ERKLLEVRGP
FIIRQLCLLL		NAENIFHSMA		DILLREEDLK		FASTMVHALN		TILLTSTELF
QLRNQLKDLK		TLESQNLFCC		LYRSWCHNPV		TTVSLCFLTQ		NYRHAYDLIQ
KFGDLEVTVD		FLAEVDKLVQ		LIECPIFTYL		RLQLLDVKNN		PYLIKALYGL
LMLLPQSSAF		QLLSHRLQCV		PNPELLQTED		SLKAAPKSQK		ADSPSIDYAE
LLQHFEKVQN		KHLEVRHQRS		GRGDHLDRRV		VL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lemaire J.F., McPherson P.S. (2006). Binding of Vac14 to neuronal nitric oxide synthase: Characterisation of a new internal PDZ-recognition motif. FEBS Lett. 580: 6948—6954. PMID 17161399 DOI:10.1016/j.febslet.2006.11.061
• Sbrissa D., Ikonomov O.C., Fenner H., Shisheva A. (2008). ArPIKfyve homomeric and heteromeric interactions scaffold PIKfyve and Sac3 in a complex to promote PIKfyve activity and functionality. J. Mol. Biol. 384: 766—779. PMID 18950639 DOI:10.1016/j.jmb.2008.10.009

Див. також

• Хромосома 16