VAPA

VAPA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RR3
Ідентифікатори
Символи	VAPA, VAP-33, VAP-A, VAP33, hVAP-33, VAMP associated protein A, VAMP-A
Зовнішні ІД	OMIM: 605703 MGI: 1353561 HomoloGene: 37824 GeneCards: VAPA
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • microtubule binding • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • cadherin binding • FFAT motif binding Клітинна компонента • integral component of membrane • везикула • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • microtubule cytoskeleton • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • endoplasmic reticulum exit site • міжклітинні контакти • bicellular tight junction • Golgi membrane • Ядерна мембрана • клітинне ядро • клітинна мембрана • azurophil granule membrane Біологічний процес • COPII-coated vesicle budding • смерть клітини • membrane fusion • protein folding in endoplasmic reticulum • sphingolipid biosynthetic process • endoplasmic reticulum organization • positive regulation by host of viral genome replication • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • protein localization to endoplasmic reticulum • negative regulation by host of viral genome replication • neuron projection development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9218	30960
Ensembl	ENSG00000101558	ENSMUSG00000024091
UniProt	Q9P0L0	Q9WV55
RefSeq (мРНК)	NM_003574 NM_194434	NM_013933 NM_001355402
RefSeq (білок)	NP_003565 NP_919415	NP_038961 NP_001342331
Локус (UCSC)	Хр. 18: 9.91 – 9.96 Mb	Хр. 17: 65.89 – 65.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VAPA (англ. VAMP associated protein A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 249 амінокислот, а молекулярна маса — 27 893.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASASGAMAK		HEQILVLDPP		TDLKFKGPFT		DVVTTNLKLR		NPSDRKVCFK
VKTTAPRRYC		VRPNSGIIDP		GSTVTVSVML		QPFDYDPNEK		SKHKFMVQTI
FAPPNTSDME		AVWKEAKPDE		LMDSKLRCVF		EMPNENDKLN		DMEPSKAVPL
NASKQDGPMP		KPHSVSLNDT		ETRKLMEECK		RLQGEMMKLS		EENRHLRDEG
LRLRKVAHSD		KPGSTSTASF		RDNVTSPLPS		LLVVIAAIFI		GFFLGKFIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, щільних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Weir M.L., Klip A., Trimble W.S. (1998). Identification of a human homologue of the vesicle-associated membrane protein (VAMP)-associated protein of 33 kDa (VAP-33): a broadly expressed protein that binds to VAMP. Biochem. J. 333: 247—251. PMID 9657962 DOI:10.1042/bj3330247
• Nishimura Y., Hayashi M., Inada H., Tanaka T. (1999). Molecular cloning and characterization of mammalian homologues of vesicle-associated membrane protein-associated (VAMP-associated) proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 254: 21—26. PMID 9920726 DOI:10.1006/bbrc.1998.9876
• Weir M.L., Xie H., Klip A., Trimble W.S. (2001). VAP-A binds promiscuously to both v- and tSNAREs. Biochem. Biophys. Res. Commun. 286: 616—621. PMID 11511104 DOI:10.1006/bbrc.2001.5437
• Saita S., Shirane M., Natume T., Iemura S., Nakayama K.I. (2009). Promotion of neurite extension by protrudin requires its interaction with vesicle-associated membrane protein-associated protein. J. Biol. Chem. 284: 13766—13777. PMID 19289470 DOI:10.1074/jbc.M807938200
• Matsuzaki F., Shirane M., Matsumoto M., Nakayama K.I. (2011). Protrudin serves as an adaptor molecule that connects KIF5 and its cargoes in vesicular transport during process formation. Mol. Biol. Cell. 22: 4602—4620. PMID 21976701 DOI:10.1091/mbc.E11-01-0068

Див. також

• Хромосома 18