VARS2

VARS2
Ідентифікатори
Символи	VARS2, COXPD20, VALRS, VARS2L, VARSL, valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial
Зовнішні ІД	OMIM: 612802 MGI: 1916165 HomoloGene: 57502 GeneCards: VARS2
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • valine-tRNA ligase activity • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • aminoacyl-tRNA editing activity Клітинна компонента • мітохондрія • гіалоплазма Біологічний процес • Біосинтез білків • tRNA aminoacylation for protein translation • valyl-tRNA aminoacylation • aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57176	68915
Ensembl	ENSG00000137411 ENSG00000206476 ENSG00000234032 ENSG00000230985 ENSG00000236178 ENSG00000223494	ENSMUSG00000038838
UniProt	Q5ST30	Q3U2A8
RefSeq (мРНК)	NM_020442 NM_001167733 NM_001167734	NM_175137
RefSeq (білок)	NP_001161205 NP_001161206 NP_065175	NP_780346
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.91 – 30.93 Mb	Хр. 17: 35.97 – 35.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VARS2 (англ. Valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 063 амінокислот, а молекулярна маса — 118 490.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPHLPLASFR		PPFWGLRHSR		GLPRFHSVST		QSEPHGSPIS		RRNREAKQKR
LREKQATLEA		EIAGESKSPA		ESIKAWRPKE		LVLYEIPTKP		GEKKDVSGPL
PPAYSPRYVE		AAWYPWWVRE		GFFKPEYQAR		LPQATGETFS		MCIPPPNVTG
SLHIGHALTV		AIQDALVRWH		RMRGDQVLWV		PGSDHAGIAT		QAVVEKQLWK
ERGVRRHELS		REAFLREVWQ		WKEAKGGEIC		EQLRALGASL		DWDRECFTMD
VGSSVAVTEA		FVRLYKAGLL		YRNHQLVNWS		CALRSAISDI		EVENRPLPGH
TQLRLPGCPT		PVSFGLLFSV		AFPVDGEPDA		EVVVGTTRPE		TLPGDVAVAV
HPDDSRYTHL		HGRQLRHPLM		GQPLPLITDY		AVQPHVGTGA		VKVTPAHSPA
DAEMGARHGL		SPLNVIAEDG		TMTSLCGDWL		QGLHRFVARE		KIMSVLSEWG
LFRGLQNHPM		VLPICSRSGD		VIEYLLKNQW		FVRCQEMGAR		AAKAVESGAL
ELSPSFHQKN		WQHWFSHIGD		WCVSRQLWWG		HQIPAYLVVE		DHAQGEEDCW
VVGRSEAEAR		EVAAELTGRP		GAELTLERDP		DVLDTWFSSA		LFPFSALGWP
QETPDLARFY		PLSLLETGSD		LLLFWVGRMV		MLGTQLTGQL		PFSKVLLHPM
VRDRQGRKMS		KSLGNVLDPR		DIISGVEMQV		LQEKLRSGNL		DPAELAIVAA
AQKKDFPHGI		PECGTDALRF		TLCSHGVQAG		DLHLSVSEVQ		SCRHFCNKIW
NALRFILNAL		GEKFVPQPAE		ELSPSSPMDA		WILSRLALAA		QECERGFLTR
ELSLVTHALH		HFWLHNLCDV		YLEAVKPVLW		HSPRPLGPPQ		VLFSCADLGL
RLLAPLMPFL		AEELWQRLPP		RPGCPPAPSI		SVAPYPSACS		LEHWRQPELE
RRFSRVQEVV		QVLRALRATY		QLTKARPRVL		LQSSEPGDQG		LFEAFLEPLG
TLGYCGAVGL		LPPGAAAPSG		WAQAPLSDTA		QVYMELQGLV		DPQIQLPLLA
ARRYKLQKQL		DSLTARTPSE		GEAGTQRQQK		LSSLQLELSK		LDKAASHLRQ
LMDEPPAPGS		PEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-трнк-синтетаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6