VPS37A

VPS37A
Ідентифікатори
Символи	VPS37A, HCRP1, PQBP2, SPG53, ESCRT-I subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 609927 MGI: 1261835 HomoloGene: 45120 GeneCards: VPS37A
Пов'язані генетичні захворювання
hereditary spastic paraplegia 53
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • ендосома • центросома • внутрішньоклітинна мембранна органела • late endosome membrane • мембрана • нуклеоплазма • endosome membrane • клітинне ядро • гіалоплазма • ESCRT I complex • host cell Біологічний процес • viral budding via host ESCRT complex • GO:0019067 viral life cycle • multivesicular body assembly • endosomal transport • protein transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • protein targeting to membrane • protein targeting to vacuole • GO:0046795 intracellular transport of virus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	137492	52348
Ensembl	ENSG00000155975	ENSMUSG00000031600
UniProt	Q8NEZ2	Q8CHS8
RefSeq (мРНК)	NM_001145152 NM_152415	NM_033560
RefSeq (білок)	NP_001138624 NP_689628 NP_001350096 NP_001350097 NP_001350098 NP_001350099 NP_001350100 NP_001350101 NP_001350102	NP_291038
Локус (UCSC)	Хр. 8: 17.25 – 17.3 Mb	Хр. 8: 40.51 – 40.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS37A (англ. VPS37A, ESCRT-I subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 44 314.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSWLFPLTKS		ASSSAAGSPG		GLTSLQQQKQ		RLIESLRNSH		SSIAEIQKDV
EYRLPFTINN		LTININILLP		PQFPQEKPVI		SVYPPIRHHL		MDKQGVYVTS
PLVNNFTMHS		DLGKIIQSLL		DEFWKNPPVL		APTSTAFPYL		YSNPSGMSPY
ASQGFPFLPP		YPPQEANRSI		TSLSVADTVS		SSTTSHTTAK		PAAPSFGVLS
NLPLPIPTVD		ASIPTSQNGF		GYKMPDVPDA		FPELSELSVS		QLTDMNEQEE
VLLEQFLTLP		QLKQIITDKD		DLVKSIEELA		RKNLLLEPSL		EAKRQTVLDK
YELLTQMKST		FEKKMQRQHE		LSESCSASAL		QARLKVAAHE		AEEESDNIAE
DFLEGKMEID		DFLSSFMEKR		TICHCRRAKE		EKLQQAIAMH		SQFHAPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

• Xu Z., Liang L., Wang H., Li T., Zhao M. (2003). HCRP1, a novel gene that is downregulated in hepatocellular carcinoma, encodes a growth-inhibitory protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 311: 1057—1066. PMID 14623289 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.10.109
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8