VPS4B

VPS4B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WR0, 1XWI, 2CPT, 2JQH, 2JQK, 4U7Y
Ідентифікатори
Символи	VPS4B, SKD1, SKD1B, VPS4-2, MIG1, vacuolar protein sorting 4 homolog B
Зовнішні ІД	OMIM: 609983 MGI: 1100499 HomoloGene: 37976 GeneCards: VPS4B
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein homodimerization activity • ATPase activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • hydrolase activity • ATP binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • центросома • spindle pole • мембрана • late endosome membrane • Flemming body • endosome membrane • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • late endosomal microautophagy • regulation of centrosome duplication • protein depolymerization • viral budding via host ESCRT complex • GO:0019067 viral life cycle • nucleus organization • cholesterol transport • negative regulation of exosomal secretion • multivesicular body assembly • negative regulation of cell death • regulation of mitotic spindle assembly • endosome organization • поділ клітини • positive regulation of centriole elongation • endosomal transport • potassium ion transport • response to lipid • ubiquitin-independent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • protein transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • positive regulation of exosomal secretion • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway • клітинний цикл • ESCRT III complex disassembly • macroautophagy • GO:0015915 транспорт • positive regulation of viral process • vacuole organization • midbody abscission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9525	20479
Ensembl	ENSG00000119541	ENSMUSG00000009907
UniProt	O75351	P46467
RefSeq (мРНК)	NM_004869	NM_009190
RefSeq (білок)	NP_004860 NP_004860.2	NP_033216
Локус (UCSC)	Хр. 18: 63.39 – 63.42 Mb	Хр. 1: 106.69 – 106.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS4B (англ. Vacuolar protein sorting 4 homolog B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 444 амінокислот, а молекулярна маса — 49 302.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSTSPNLQK		AIDLASKAAQ		EDKAGNYEEA		LQLYQHAVQY		FLHVVKYEAQ
GDKAKQSIRA		KCTEYLDRAE		KLKEYLKNKE		KKAQKPVKEG		QPSPADEKGN
DSDGEGESDD		PEKKKLQNQL		QGAIVIERPN		VKWSDVAGLE		GAKEALKEAV
ILPIKFPHLF		TGKRTPWRGI		LLFGPPGTGK		SYLAKAVATE		ANNSTFFSIS
SSDLVSKWLG		ESEKLVKNLF		QLARENKPSI		IFIDEIDSLC		GSRSENESEA
ARRIKTEFLV		QMQGVGVDND		GILVLGATNI		PWVLDSAIRR		RFEKRIYIPL
PEPHARAAMF		KLHLGTTQNS		LTEADFRELG		RKTDGYSGAD		ISIIVRDALM
QPVRKVQSAT		HFKKVRGPSR		ADPNHLVDDL		LTPCSPGDPG		AIEMTWMDVP
GDKLLEPVVS		MSDMLRSLSN		TKPTVNEHDL		LKLKKFTEDF		GQEG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shim S., Merrill S.A., Hanson P.I. (2008). Novel interactions of ESCRT-III with LIP5 and VPS4 and their implications for ESCRT-III disassembly. Mol. Biol. Cell. 19: 2661—2672. PMID 18385515 DOI:10.1091/mbc.E07-12-1263
• Howard T.L., Stauffer D.R., Degnin C.R., Hollenberg S.M. (2001). CHMP1 functions as a member of a newly defined family of vesicle trafficking proteins. J. Cell Sci. 114: 2395—2404. PMID 11559748

Див. також

• Хромосома 18