WDFY3

WDFY3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3WIM
Ідентифікатори
Символи	WDFY3, ALFY, ZFYVE25, WD repeat and FYVE domain containing 3, BCHS, MCPH18
Зовнішні ІД	OMIM: 617485 MGI: 1096875 HomoloGene: 22855 GeneCards: WDFY3
Пов'язані генетичні захворювання
syndromic intellectual disability
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 1-phosphatidylinositol binding • beta-N-acetylglucosaminylglycopeptide beta-1,4-galactosyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • lipid binding Клітинна компонента • Atg12-Atg5-Atg16 complex • PML body • Ядерна мембрана • nuclear envelope • extrinsic component of membrane • extrinsic component of autophagosome membrane • autophagosome • цитоплазма • inclusion body • мембрана • клітинне ядро • ядерце • клітинна мембрана • гіалоплазма • аксон • cell projection • перикаріон Біологічний процес • aggrephagy • Автофагія • multicellular organism development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23001	72145
Ensembl	ENSG00000163625	ENSMUSG00000043940
UniProt	Q8IZQ1	Q6VNB8
RefSeq (мРНК)	NM_014991 NM_178583 NM_178585	NM_172882 NM_028124
RefSeq (білок)	NP_055806	NP_766470
Локус (UCSC)	Хр. 4: 84.67 – 84.97 Mb	Хр. 5: 101.98 – 102.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WDFY3 (англ. WD repeat and FYVE domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 526 амінокислот, а молекулярна маса — 395 258.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNMVKRIMGR		PRQEECSPQD		NALGLMHLRR		LFTELCHPPR		HMTQKEQEEK
LYMMLPVFNR		VFGNAPPNTM		TEKFSDLLQF		TTQVSRLMVT		EIRRRASNKS
TEAASRAIVQ		FLEINQSEEA		SRGWMLLTTI		NLLASSGQKT		VDCMTTMSVP
STLVKCLYLF		FDLPHVPEAV		GGAQNELPLA		ERRGLLQKVF		VQILVKLCSF
VSPAEELAQK		DDLQLLFSAI		TSWCPPYNLP		WRKSAGEVLM		TISRHGLSVN
VVKYIHEKEC		LSTCVQNMQQ		SDDLSPLEIV		EMFAGLSCFL		KDSSDVSQTL
LDDFRIWQGY		NFLCDLLLRL		EQAKEAESKD		ALKDLVNLIT		SLTTYGVSEL
KPAGITTGAP		FLLPGFAVPQ		PAGKGHSVRN		VQAFAVLQNA		FLKAKTSFLA
QIILDAITNI		YMADNANYFI		LESQHTLSQF		AEKISKLPEV		QNKYFEMLEF
VVFSLNYIPC		KELISVSILL		KSSSSYHCSI		IAMKTLLKFT		RHDYIFKDVF
REVGLLEVMV		NLLHKYAALL		KDPTQALNEQ		GDSRNNSSVE		DQKHLALLVM
ETLTVLLQGS		NTNAGIFREF		GGARCAHNIV		KYPQCRQHAL		MTIQQLVLSP
NGDDDMGTLL		GLMHSAPPTE		LQLKTDILRA		LLSVLRESHR		SRTVFRKVGG
FVYITSLLVA		MERSLSCPPK		NGWEKVNQNQ		VFELLHTVFC		TLTAAMRYEP
ANSHFFKTEI		QYEKLADAVR		FLGCFSDLRK		ISAMNVFPSN		TQPFQRLLEE
DVISIESVSP		TLRHCSKLFI		YLYKVATDSF		DSRAEQIPPC		LTSESSLPSP
WGTPALSRKR		HAYHSVSTPP		VYPPKNVADL		KLHVTTSSLQ		SSDAVIIHPG
AMLAMLDLLA		SVGSVTQPEH		ALDLQLAVAN		ILQSLVHTER		NQQVMCEAGL
HARLLQRCSA		ALADEDHSLH		PPLQRMFERL		ASQALEPMVL		REFLRLASPL
NCGAWDKKLL		KQYRVHKPSS		LSYEPEMRSS		MITSLEGLGT		DNVFSLHEDN
HYRISKSLVK		SAEGSTVPLT		RVKCLVSMTT		PHDIRLHGSS		VTPAFVEFDT
SLEGFGCLFL		PSLAPHNAPT		NNTVTTGLID		GAVVSGIGSG		ERFFPPPSGL
SYSSWFCIEH		FSSPPNNHPV		RLLTVVRRAN		SSEQHYVCLA		IVLSAKDRSL
IVSTKEELLQ		NYVDDFSEES		SFYEILPCCA		RFRCGELIIE		GQWHHLVLVM
SKGMLKNSTA		ALYIDGQLVN		TVKLHYVHST		PGGSGSANPP		VVSTVYAYIG
TPPAQRQIAS		LVWRLGPTHF		LEEVLPSSNV		TTIYELGPNY		VGSFQAVCMP
CKDAKSEGVV		PSPVSLVPEE		KVSFGLYALS		VSSLTVARIR		KVYNKLDSKA
IAKQLGISSH		ENATPVKLIH		NSAGHLNGSA		RTIGAALIGY		LGVRTFVPKP
VATTLQYVGG		AAAILGLVAM		ASDVEGLYAA		VKALVCVVKS		NPLASKEMER
IKGYQLLAML		LKKKRSLLNS		HILHLTFSLV		GTVDSGHETS		IIPNSTAFQD
LLCDFEVWLH		APYELHLSLF		EHFIELLTES		SEASKNAKLM		REFQLIPKLL
LTLRDMSLSQ		PTIAAISNVL		SFLLQGFPSS		NDLLRFGQFI		SSTLPTFAVC
EKFVVMEINN		EEKLDTGTEE		EFGGLVSANL		ILLRNRLLDI		LLKLIYTSKE
KTSINLQACE		ELVKTLGFDW		IMMFMEEHLH		STTVTAAMRI		LVVLLSNQSI
LIKFKEGLSG		GGWLEQTDSV		LTNKIGTVLG		FNVGRSAGGR		STVREINRDA
CHFPGFPVLQ		SFLPKHTNVP		ALYFLLMALF		LQQPVSELPE		NLQVSVPVIS
CRSKQGCQFD		LDSIWTFIFG		VPASSGTVVS		SIHNVCTEAV		FLLLGMLRSM
LTSPWQSEEE		GSWLREYPVT		LMQFFRYLYH		NVPDLASMWM		SPDFLCALAA
TVFPFNIRPY		SEMVTDLDDE		VGSPAEEFKA		FAADTGMNRS		QSEYCNVGTK
TYLTNHPAKK		FVFDFMRVLI		IDNLCLTPAS		KQTPLIDLLL		EASPERSTRT
QQKEFQTYIL		DSVMDHLLAA		DVLLGEDASL		PITSGGSYQV		LVNNVFYFTQ
RVVDKLWQGM		FNKESKLLID		FIIQLIAQSK		RRSQGLSLDA		VYHCLNRTIL
YQFSRAHKTV		PQQVALLDSL		RVLTVNRNLI		LGPGNHDQEF		ISCLAHCLIN
LHVGSNVDGF		GLEAEARMTT		WHIMIPSDIE		PDGSYSQDIS		EGRQLLIKAV
NRVWTELIHS		KKQVLEELFK		VTLPVNERGH		VDIATARPLI		EEAALKCWQN
HLAHEKKCIS		RGEALAPTTQ		SKLSRVSSGF		GLSKLTGSRR		NRKESGLNKH
SLSTQEISQW		MFTHIAVVRD		LVDTQYKEYQ		ERQQNALKYV		TEEWCQIECE
LLRERGLWGP		PIGSHLDKWM		LEMTEGPCRM		RKKMVRNDMF		YNHYPYVPET
EQETNVASEI		PSKQPETPDD		IPQKKPARYR		RAVSYDSKEY		YMRLASGNPA
IVQDAIVESS		EGEAAQQEPE		HGEDTIAKVK		GLVKPPLKRS		RSAPDGGDEE
NQEQLQDQIA		EGSSIEEEEK		TDNATLLRLL		EEGEKIQHMY		RCARVQGLDT
SEGLLLFGKE		HFYVIDGFTM		TATREIRDIE		TLPPNMHEPI		IPRGARQGPS
QLKRTCSIFA		YEDIKEVHKR		RYLLQPIAVE		VFSGDGRNYL		LAFQKGIRNK
VYQRFLAVVP		SLTDSSESVS		GQRPNTSVEQ		GSGLLSTLVG		EKSVTQRWER
GEISNFQYLM		HLNTLAGRSY		NDLMQYPVFP		WILADYDSEE		VDLTNPKTFR
NLAKPMGAQT		DERLAQYKKR		YKDWEDPNGE		TPAYHYGTHY		SSAMIVASYL
VRMEPFTQIF		LRLQGGHFDL		ADRMFHSVRE		AWYSASKHNM		ADVKELIPEF
FYLPEFLFNS		NNFDLGCKQN		GTKLGDVILP		PWAKGDPREF		IRVHREALEC
DYVSAHLHEW		IDLIFGYKQQ		GPAAVEAVNV		FHHLFYEGQV		DIYNINDPLK
ETATIGFINN		FGQIPKQLFK		KPHPPKRVRS		RLNGDNAGIS		VLPGSTSDKI
FFHHLDNLRP		SLTPVKELKE		PVGQIVCTDK		GILAVEQNKV		LIPPTWNKTF
AWGYADLSCR		LGTYESDKAM		TVYECLSEWG		QILCAICPNP		KLVITGGTST
VVCVWEMGTS		KEKAKTVTLK		QALLGHTDTV		TCATASLAYH		IIVSGSRDRT
CIIWDLNKLS		FLTQLRGHRA		PVSALCINEL		TGDIVSCAGT		YIHVWSINGN
PIVSVNTFTG		RSQQIICCCM		SEMNEWDTQN		VIVTGHSDGV		VRFWRMEFLQ
VPETPAPEPA		EVLEMQEDCP		EAQIGQEAQD		EDSSDSEADE		QSISQDPKDT
PSQPSSTSHR		PRAASCRATA		AWCTDSGSDD		SRRWSDQLSL		DEKDGFIFVN
YSEGQTRAHL		QGPLSHPHPN		PIEVRNYSRL		KPGYRWERQL		VFRSKLTMHT
AFDRKDNAHP		AEVTALGISK		DHSRILVGDS		RGRVFSWSVS		DQPGRSAADH
WVKDEGGDSC		SGCSVRFSLT		ERRHHCRNCG		QLFCQKCSRF		QSEIKRLKIS
SPVRVCQNCY		YNLQHERGSE		DGPRNC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як автофагія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hocking L.J., Mellis D.J., McCabe P.S., Helfrich M.H., Rogers M.J. (2010). Functional interaction between sequestosome-1/p62 and autophagy-linked FYVE-containing protein WDFY3 in human osteoclasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 402: 543—548. PMID 20971078 DOI:10.1016/j.bbrc.2010.10.076

Див. також

• Хромосома 4