WDHD1

WDHD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D7L
Ідентифікатори
Символи	WDHD1, AND-1, CHTF4, CTF4, AND1, WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1, Ctf4
Зовнішні ІД	OMIM: 608126 MGI: 2443514 HomoloGene: 56019 GeneCards: WDHD1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • chromatin binding • RNA binding • RNA polymerase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • центромера • replication fork protection complex • nuclear replication fork Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • regulation of chromosome organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0007067 мітоз • DNA-dependent DNA replication • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11169	218973
Ensembl	ENSG00000198554	ENSMUSG00000037572
UniProt	O75717	P59328
RefSeq (мРНК)	NM_001008396 NM_007086	NM_172598 NM_001360532
RefSeq (білок)	NP_001008397 NP_009017	NP_766186 NP_001347461
Локус (UCSC)	Хр. 14: 54.94 – 55.03 Mb	Хр. 14: 47.48 – 47.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WDHD1 (англ. WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 129 амінокислот, а молекулярна маса — 125 967.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPATRKPMRY		GHTEGHTEVC		FDDSGSFIVT		CGSDGDVRIW		EDLDDDDPKF
INVGEKAYSC		ALKSGKLVTA		VSNNTIQVHT		FPEGVPDGIL		TRFTTNANHV
VFNGDGTKIA		AGSSDFLVKI		VDVMDSSQQK		TFRGHDAPVL		SLSFDPKDIF
LASASCDGSV		RVWQISDQTC		AISWPLLQKC		NDVINAKSIC		RLAWQPKSGK
LLAIPVEKSV		KLYRRESWSH		QFDLSDNFIS		QTLNIVTWSP		CGQYLAAGSI
NGLIIVWNVE		TKDCMERVKH		EKGYAICGLA		WHPTCGRISY		TDAEGNLGLL
ENVCDPSGKT		SSSKVSSRVE		KDYNDLFDGD		DMSNAGDFLN		DNAVEIPSFS
KGIINDDEDD		EDLMMASGRP		RQRSHILEDD		ENSVDISMLK		TGSSLLKEEE
EDGQEGSIHN		LPLVTSQRPF		YDGPMPTPRQ		KPFQSGSTPL		HLTHRFMVWN
SIGIIRCYND		EQDNAIDVEF		HDTSIHHATH		LSNTLNYTIA		DLSHEAILLA
CESTDELASK		LHCLHFSSWD		SSKEWIIDLP		QNEDIEAICL		GQGWAAAATS
ALLLRLFTIG		GVQKEVFSLA		GPVVSMAGHG		EQLFIVYHRG		TGFDGDQCLG
VQLLELGKKK		KQILHGDPLP		LTRKSYLAWI		GFSAEGTPCY		VDSEGIVRML
NRGLGNTWTP		ICNTREHCKG		KSDHYWVVGI		HENPQQLRCI		PCKGSRFPPT
LPRPAVAILS		FKLPYCQIAT		EKGQMEEQFW		RSVIFHNHLD		YLAKNGYEYE
ESTKNQATKE		QQELLMKMLA		LSCKLEREFR		CVELADLMTQ		NAVNLAIKYA
SRSRKLILAQ		KLSELAVEKA		AELTATQVEE		EEEEEDFRKK		LNAGYSNTAT
EWSQPRFRNQ		VEEDAEDSGE		ADDEEKPEIH		KPGQNSFSKS		TNSSDVSAKS
GAVTFSSQGR		VNPFKVSASS		KEPAMSMNSA		RSTNILDNMG		KSSKKSTALS
RTTNNEKSPI		IKPLIPKPKP		KQASAASYFQ		KRNSQTNKTE		EVKEENLKNV
LSETPAICPP		QNTENQRPKT		GFQMWLEENR		SNILSDNPDF		SDEADIIKEG
MIRFRVLSTE		ERKVWANKAK		GETASEGTEA		KKRKRVVDES		DETENQEEKA
KENLNLSKKQ		KPLDFSTNQK		LSAFAFKQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 14