WIPI1

WIPI1
Ідентифікатори
Символи	WIPI1, ATG18, ATG18A, WIPI49, WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609224 MGI: 1261864 HomoloGene: 117983 GeneCards: WIPI1
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • androgen receptor binding • signaling receptor binding • estrogen receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding Клітинна компонента • цитоплазма • phagophore assembly site membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • trans-Golgi network • autophagosome membrane • endosome membrane • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • phagophore assembly site • гіалоплазма • extrinsic component of membrane Біологічний процес • vesicle targeting, trans-Golgi to endosome • автофагія • IRE1-mediated unfolded protein response • macroautophagy • autophagy of mitochondrion • protein lipidation • protein localization to phagophore assembly site • autophagy of nucleus • autophagosome assembly • cellular response to starvation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55062	52639
Ensembl	ENSG00000070540	ENSMUSG00000041895
UniProt	Q5MNZ9	Q8R3E3
RefSeq (мРНК)	NM_017983 NM_001320772	NM_145940
RefSeq (білок)	NP_001307701 NP_060453	NP_666052
Локус (UCSC)	Хр. 17: 68.42 – 68.46 Mb	Хр. 11: 109.46 – 109.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WIPI1 (англ. WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 48 673.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAEAADAPP		GGVESALSCF		SFNQDCTSLA		TGTKAGYKLF		SLSSVEQLDQ
VHGSNEIPDV		YIVERLFSSS		LVVVVSHTKP		RQMNVYHFKK		GTEICNYSYS
SNILSIRLNR		QRLLVCLEES		IYIHNIKDMK		LLKTLLDIPA		NPTGLCALSI
NHSNSYLAYP		GSLTSGEIVL		YDGNSLKTVC		TIAAHEGTLA		AITFNASGSK
LASASEKGTV		IRVFSVPDGQ		KLYEFRRGMK		RYVTISSLVF		SMDSQFLCAS
SNTETVHIFK		LEQVTNSRPE		EPSTWSGYMG		KMFMAATNYL		PTQVSDMMHQ
DRAFATARLN		FSGQRNICTL		STIQKLPRLL		VASSSGHLYM		YNLDPQDGGE
CVLIKTHSLL		GSGTTEENKE		NDLRPSLPQS		YAATVARPSA		SSASTVPGYS
EDGGALRGEV		IPEHEFATGP		VCLDDENEFP		PIILCRGNQK		GKTKQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jeffries T.R., Dove S.K., Michell R.H., Parker P.J. (2004). PtdIns-specific MPR pathway association of a novel WD40 repeat protein, WIPI49. Mol. Biol. Cell. 15: 2652—2663. PMID 15020712 DOI:10.1091/mbc.E03-10-0732
• Proikas-Cezanne T., Ruckerbauer S., Stierhof Y.D., Berg C., Nordheim A. (2007). Human WIPI-1 puncta-formation: a novel assay to assess mammalian autophagy. FEBS Lett. 581: 3396—3404. PMID 17618624 DOI:10.1016/j.febslet.2007.06.040
• Itakura E., Mizushima N. (2010). Characterization of autophagosome formation site by a hierarchical analysis of mammalian Atg proteins. Autophagy. 6: 764—776. PMID 20639694 DOI:10.4161/auto.6.6.12709
• Ho H., Kapadia R., Al-Tahan S., Ahmad S., Ganesan A.K. (2011). WIPI1 coordinates melanogenic gene transcription and melanosome formation via TORC1 inhibition. J. Biol. Chem. 286: 12509—12523. PMID 21317285 DOI:10.1074/jbc.M110.200543
• Proikas-Cezanne T., Robenek H. (2011). Freeze-fracture replica immunolabelling reveals human WIPI-1 and WIPI-2 as membrane proteins of autophagosomes. J. Cell. Mol. Med. 15: 2007—2010. PMID 21564513 DOI:10.1111/j.1582-4934.2011.01339.x

Див. також

• Хромосома 17