XAF1

XAF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LXW
Ідентифікатори
Символи	XAF1, BIRC4BP, HSXIAPAF1, XIAPAF1, XIAP associated factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606717 MGI: 3772572 HomoloGene: 49488 GeneCards: XAF1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding Клітинна компонента • гіалоплазма • цитоплазма • клітинне ядро • мітохондрія Біологічний процес • GO:0097285 апоптоз • type I interferon signaling pathway • response to interferon-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54739	327959
Ensembl	ENSG00000132530	ENSMUSG00000040483
UniProt	Q6GPH4	Q5NBU8
RefSeq (мРНК)	NM_017523 NM_199139 NM_001353134 NM_001353135 NM_001353136 NM_001353137 NM_001353138 NM_001353139 NM_001353140	NM_001037713 NM_001291153
RefSeq (білок)	NP_059993 NP_954590 NP_001340063 NP_001340064 NP_001340065 NP_001340066 NP_001340067 NP_001340068 NP_001340069	NP_001032802 NP_001278082
Локус (UCSC)	Хр. 17: 6.76 – 6.78 Mb	Хр. 11: 72.19 – 72.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

XAF1 (англ. XIAP associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 34 626.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGDFSVCRN		CKRHVVSANF		TLHEAYCLRF		LVLCPECEEP		VPKETMEEHC
KLEHQQVGCT		MCQQSMQKSS		LEFHKANECQ		ERPVECKFCK		LDMQLSKLEL
HESYCGSRTE		LCQGCGQFIM		HRMLAQHRDV		CRSEQAQLGK		GERISAPERE
IYCHYCNQMI		PENKYFHHMG		KCCPDSEFKK		HFPVGNPEIL		PSSLPSQAAE
NQTSTMEKDV		RPKTRSINRF		PLHSESSSKK		APRSKNKTLD		PLLMSEPKPR
TSSPRGDKAA		YDILRRCSQC		GILLPLPILN		QHQEKCRWLA		SSKGKQVRNF
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yin W., Cheepala S., Clifford J.L. (2006). Identification of a novel splice variant of X-linked inhibitor of apoptosis-associated factor 1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339: 1148—1154. PMID 16343440 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.11.128
• Xia Y., Novak R., Lewis J., Duckett C.S., Phillips A.C. (2006). Xaf1 can cooperate with TNFalpha in the induction of apoptosis, independently of interaction with XIAP. Mol. Cell. Biochem. 286: 67—76. PMID 16432762 DOI:10.1007/s11010-005-9094-2

Див. також

• Хромосома 17