XPC

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
XPC
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи XPC, RAD4, XP3, XPCC, p125, xeroderma pigmentosum, complementation group C, XPC complex subunit, DNA damage recognition and repair factor
Зовнішні ІД OMIM: 613208 MGI: 103557 HomoloGene: 3401 GeneCards: XPC
Пов'язані генетичні захворювання
xeroderma pigmentosum group C[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001145769
NM_004628
NM_009531
RefSeq (білок)
NP_004619
NP_001341655
NP_001341656
NP_001341658
NP_001341659
NP_033557
Локус (UCSC) н/д Хр. 6: 91.47 – 91.49 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

XPC (англ. XPC complex subunit, DNA damage recognition and repair factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 940 амінокислот, а молекулярна маса — 105 953[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MARKRAAGGEPRGRELRSQKSKAKSKARREEEEEDAFEDEKPPKKSLLSK
VSQGKRKRGCSHPGGSADGPAKKKVAKVTVKSENLKVIKDEALSDGDDLR
DFPSDLKKAHHLKRGATMNEDSNEEEEESENDWEEVEELSEPVLGDVRES
TAFSRSLLPVKPVEIEIETPEQAKTRERSEKIKLEFETYLRRAMKRFNKG
VHEDTHKVHLLCLLANGFYRNNICSQPDLHAIGLSIIPARFTRVLPRDVD
TYYLSNLVKWFIGTFTVNAELSASEQDNLQTTLERRFAIYSARDDEELVH
IFLLILRALQLLTRLVLSLQPIPLKSATAKGKKPSKERLTADPGGSSETS
SQVLENHTKPKTSKGTKQEETFAKGTCRPSAKGKRNKGGRKKRSKPSSSE
EDEGPGDKQEKATQRRPHGRERRVASRVSYKEESGSDEAGSGSDFELSSG
EASDPSDEDSEPGPPKQRKAPAPQRTKAGSKSASRTHRGSHRKDPSLPAA
SSSSSSSKRGKKMCSDGEKAEKRSIAGIDQWLEVFCEQEEKWVCVDCVHG
VVGQPLTCYKYATKPMTYVVGIDSDGWVRDVTQRYDPVWMTVTRKCRVDA
EWWAETLRPYQSPFMDREKKEDLEFQAKHMDQPLPTAIGLYKNHPLYALK
RHLLKYEAIYPETAAILGYCRGEAVYSRDCVHTLHSRDTWLKKARVVRLG
EVPYKMVKGFSNRARKARLAEPQLREENDLGLFGYWQTEEYQPPVAVDGK
VPRNEFGNVYLFLPSMMPIGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFH
GGYSHPVTDGYIVCEEFKDVLLTAWENEQAVIERKEKEKKEKRALGNWKL
LAKGLLIRERLKRRYGPKSEAAAPHTDAGGGLSSDEEEGTSSQAEAARIL
AASWPQNREDEEKQKLKGGPKKTKREKKAAASHLFPFEQL

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Legerski R.J., Peterson C.A. (1992). Expression cloning of a human DNA repair gene involved in Xeroderma pigmentosum group C. Nature. 359: 70—73. PMID 1522891 DOI:10.1038/359070a0
  • Legerski R.J., Peterson C.A. (1992). Nature. 360: 610—610. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 1461286 DOI:10.1038/360610b0
  • Batty D., Rapic'-Otrin V., Levine A.S., Wood R.D. (2000). Stable binding of human XPC complex to irradiated DNA confers strong discrimination for damaged sites. J. Mol. Biol. 300: 275—290. PMID 10873465 DOI:10.1006/jmbi.2000.3857
  • Sugasawa K., Shimizu Y., Iwai S., Hanaoka F. (2002). A molecular mechanism for DNA damage recognition by the xeroderma pigmentosum group C protein complex. DNA Repair. 1: 95—107. PMID 12509299 DOI:10.1016/S1568-7864(01)00008-8
  • Shimizu Y., Iwai S., Hanaoka F., Sugasawa K. (2003). Xeroderma pigmentosum group C protein interacts physically and functionally with thymine DNA glycosylase. EMBO J. 22: 164—173. PMID 12505994 DOI:10.1093/emboj/cdg016

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з XPC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12816 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
  5. UniProt, Q01831 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]