YEATS2

YEATS2
Ідентифікатори
Символи	YEATS2, YEATS domain containing 2, FAME4
Зовнішні ІД	OMIM: 613373 MGI: 2447762 HomoloGene: 9967 GeneCards: YEATS2
Онтологія гена Молекулярна функція • TBP-class protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0031493 histone binding • modification-dependent protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • mitotic spindle • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3 acetylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55689	208146
Ensembl	ENSG00000163872	ENSMUSG00000041215
UniProt	Q9ULM3	Q3TUF7
RefSeq (мРНК)	NM_018023 NM_001351369 NM_001351370 NM_001351371	NM_001033237 NM_001145930 NM_001145931
RefSeq (білок)	NP_060493 NP_001338298 NP_001338299 NP_001338300	NP_001028409 NP_001139402 NP_001139403
Локус (UCSC)	Хр. 3: 183.7 – 183.81 Mb	Хр. 16: 19.96 – 20.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

YEATS2 (англ. YEATS domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 422 амінокислот, а молекулярна маса — 150 782.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGIKRTIKE		TDPDYEDVSV		ALPNKRHKAI		ENSARDAAVQ		KIETIIKEQF
ALEMKNKEHE		IEVIDQRLIE		ARRMMDKLRA		CIVANYYASA		GLLKVSEGSK
TCDTMVFNHP		AIKKFLESPS		RSSSPANQRA		ETPSANHSES		DSLSQHNDFL
SDKDNNSNMD		IEERLSNNME		QRPSRNTGRD		TSRITGSHKT		EQRNADLTDE
TSRLFVKKTI		VVGNVSKYIP		PDKREENDQS		THKWMVYVRG		SRREPSINHF
VKKVWFFLHP		SYKPNDLVEV		REPPFHLTRR		GWGEFPVRVQ		VHFKDSQNKR
IDIIHNLKLD		RTYTGLQTLG		AETVVDVELH		RHSLGEDCIY		PQSSESDISD
APPSLPLTIP		APVKASSPIK		QSHEPVPDTS		VEKGFPASTE		AERHTPFYAL
PSSLERTPTK		MTTSQKVTFC		SHGNSAFQPI		ASSCKIVPQS		QVPNPESPGK
SFQPITMSCK		IVSGSPISTP		SPSPLPRTPT		STPVHVKQGT		AGSVINNPYV
IMDKQPGQVI		GATTPSTGSP		TNKISTASQV		SQGTGSPVPK		IHGSSFVTST
VKQEDSLFAS		MPPLCPIGSH		PKVQSPKPIT		GGLGAFTKVI		IKQEPGEAPH
VPATGAASQS		PLPQYVTVKG		GHMIAVSPQK		QVITPGEGIA		QSAKVQPSKV
VGVPVGSALP		STVKQAVAIS		GGQILVAKAS		SSVSKAVGPK		QVVTQGVAKA
IVSGGGGTIV		AQPVQTLTKA		QVTAAGPQKS		GSQGSVMATL		QLPATNLANL
ANLPPGTKLY		LTTNSKNPSG		KGKLLLIPQG		AILRATNNAN		LQSGSAASGG
SGAGGGGGGG		GGGGSGSGGG		GSTGGGGGTA		GGGTQSTAGP		GGISQHLTYT
SYILKQTPQG		TFLVGQPSPQ		TSGKQLTTGS		VVQGTLGVST		SSAQGQQTLK
VISGQKTTLF		TQAAHGGQAS		LMKISDSTLK		TVPATSQLSK		PGTTMLRVAG
GVITTATSPA		VALSANGPAQ		QSEGMAPVSS		STVSSVTKTS		GQQQVCVSQA
TVGTCKAATP		TVVSATSLVP		TPNPISGKAT		VSGLLKIHSS		QSSPQQAVLT
IPSQLKPLSV		NTSGGVQTIL		MPVNKVVQSF		STSKPPAILP		VAAPTPVVPS
SAPAAVAKVK		TEPETPGPSC		LSQEGQTAVK		TEESSELGNY		VIKIDHLETI
QQLLTAVVKK		IPLITAKSED		ASCFSAKSVE		QYYGWNIGKR		RAAEWQRAMT
MRKVLQEILE		KNPRFHHLTP		LKTKHIAHWC		RCHGYTPPDP		ESLRNDGDSI
EDVLTQIDSE		PECPSSFSSA		DNLCRKLEDL		QQFQKREPEN		EEEVDILSLS
EPVKINIKKE		QEEKQEEVKF		YLPPTPGSEF		IGDVTQKIGI		TLQPVALHRN
VYASVVEDMI		LKATEQLVND		ILRQALAVGY		QTASHNRIPK		EITVSNIHQA
ICNIPFLDFL		TNKHMGILNE		DQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 3