ZCCHC6

ZCCHC6
Ідентифікатори
Символи	TUT7, PAPD6, zinc finger CCHC-type containing 6, TENT3B, ZCCHC6, terminal uridylyl transferase 7
Зовнішні ІД	OMIM: 613467 MGI: 2387179 HomoloGene: 51941 GeneCards: TUT7
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotidyltransferase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding • RNA uridylyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • miRNA binding • uridylyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • histone mRNA catabolic process • RNA 3'-end processing • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • oocyte maturation • negative regulation of transposition, RNA-mediated • GO:0061715 miRNA metabolic process • pre-miRNA processing • RNA 3' uridylation • polyuridylation-dependent mRNA catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79670	214290
Ensembl	ENSG00000083223	ENSMUSG00000035248
UniProt	Q5VYS8	Q5BLK4
RefSeq (мРНК)	NM_001185059 NM_001185074 NM_024617 NM_001330718	NM_153538 NM_001373962 NM_001373963 NM_001373964
RefSeq (білок)	NP_001171988 NP_001172003 NP_001317647 NP_078893	NP_705766 NP_001360891 NP_001360892 NP_001360893
Локус (UCSC)	Хр. 9: 86.29 – 86.35 Mb	Хр. 13: 59.92 – 59.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZCCHC6 (англ. Zinc finger CCHC-type containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 495 амінокислот, а молекулярна маса — 171 229.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDTAKPYFV		KRTKDRGTMD		DDDFRRGHPQ		QDYLIIDDHA		KGHGSKMEKG
LQKKKITPGN		YGNTPRKGPC		AVSSNPYAFK		NPIYSQPAWM		NDSHKDQSKR
WLSDEHTGNS		DNWREFKPGP		RIPVINRQRK		DSFQENEDGY		RWQDTRGCRT
VRRLFHKDLT		SLETTSEMEA		GSPENKKQRS		RPRKPRKTRN		EENEQDGDLE
GPVIDESVLS		TKELLGLQQA		EERLKRDCID		RLKRRPRNYP		TAKYTCRLCD
VLIESIAFAH		KHIKEKRHKK		NIKEKQEEEL		LTTLPPPTPS		QINAVGIAID
KVVQEFGLHN		ENLEQRLEIK		RIMENVFQHK		LPDCSLRLYG		SSCSRLGFKN
SDVNIDIQFP		AIMSQPDVLL		LVQECLKNSD		SFIDVDADFH		ARVPVVVCRE
KQSGLLCKVS		AGNENACLTT		KHLTALGKLE		PKLVPLVIAF		RYWAKLCSID
RPEEGGLPPY		VFALMAIFFL		QQRKEPLLPV		YLGSWIEGFS		LSKLGNFNLQ
DIEKDVVIWE		HTDSAAGDTG		ITKEEAPRET		PIKRGQVSLI		LDVKHQPSVP
VGQLWVELLR		FYALEFNLAD		LVISIRVKEL		VSRELKDWPK		KRIAIEDPYS
VKRNVARTLN		SQPVFEYILH		CLRTTYKYFA		LPHKITKSSL		LKPLNAITCI
SEHSKEVINH		HPDVQTKDDK		LKNSVLAQGP		GATSSAANTC		KVQPLTLKET
AESFGSPPKE		EMGNEHISVH		PENSDCIQAD		VNSDDYKGDK		VYHPETGRKN
EKEKVGRKGK		HLLTVDQKRG		EHVVCGSTRN		NESESTLDLE		GFQNPTAKEC
EGLATLDNKA		DLDGESTEGT		EELEDSLNHF		THSVQGQTSE		MIPSDEEEED
DEEEEEEEEP		RLTINQREDE		DGMANEDELD		NTYTGSGDED		ALSEEDDELG
EAAKYEDVKE		CGKHVERALL		VELNKISLKE		ENVCEEKNSP		VDQSDFFYEF
SKLIFTKGKS		PTVVCSLCKR		EGHLKKDCPE		DFKRIQLEPL		PPLTPKFLNI
LDQVCIQCYK		DFSPTIIEDQ		AREHIRQNLE		SFIRQDFPGT		KLSLFGSSKN
GFGFKQSDLD		VCMTINGLET		AEGLDCVRTI		EELARVLRKH		SGLRNILPIT
TAKVPIVKFF		HLRSGLEVDI		SLYNTLALHN		TRLLSAYSAI		DPRVKYLCYT
MKVFTKMCDI		GDASRGSLSS		YAYTLMVLYF		LQQRNPPVIP		VLQEIYKGEK
KPEIFVDGWN		IYFFDQIDEL		PTYWSECGKN		TESVGQLWLG		LLRFYTEEFD
FKEHVISIRR		KSLLTTFKKQ		WTSKYIVIED		PFDLNHNLGA		GLSRKMTNFI
MKAFINGRRV		FGIPVKGFPK		DYPSKMEYFF		DPDVLTEGEL		APNDRCCRIC
GKIGHFMKDC		PMRRKVRRRR		DQEDALNQRY		PENKEKRSKE		DKEIHNKYTE
REVSTKEDKP		IQCTPQKAKP		MRAAADLGRE		KILRPPVEKW		KRQDDKDLRE
KRCFICGREG		HIKKECPQFK		GSSGSLSSKY		MTQGKASAKR		TQQES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708
• Rissland O.S., Mikulasova A., Norbury C.J. (2007). Efficient RNA polyuridylation by noncanonical poly(A) polymerases. Mol. Cell. Biol. 27: 3612—3624. PMID 17353264 DOI:10.1128/MCB.02209-06
• Thornton J.E., Chang H.M., Piskounova E., Gregory R.I. (2012). Lin28-mediated control of let-7 microRNA expression by alternative TUTases Zcchc11 (TUT4) and Zcchc6 (TUT7). RNA. 18: 1875—1885. PMID 22898984 DOI:10.1261/rna.034538.112

Див. також

• Хромосома 9