ZNF398

ZNF398
Ідентифікатори
Символи	ZNF398, P51, P71, ZER6, zinc finger protein 398
Зовнішні ІД	MGI: 1917856 HomoloGene: 12358 GeneCards: ZNF398
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57541	272347
Ensembl	ENSG00000197024	ENSMUSG00000062519
UniProt	Q8TD17	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_020781 NM_170686	NM_027477 NM_173034
RefSeq (білок)	NP_065832 NP_733787	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 149.13 – 149.18 Mb	Хр. 6: 47.81 – 47.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF398 (англ. Zinc finger protein 398) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 642 амінокислот, а молекулярна маса — 71 311.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEAAPAPTS		EWDSECLTSL		QPLPLPTPPA		ANEAHLQTAA		ISLWTVVAAV
QAIERKVEIH		SRRLLHLEGR		TGTAEKKLAS		CEKTVTELGN		QLEGKWAVLG
TLLQEYGLLQ		RRLENLENLL		RNRNFWILRL		PPGIKGDIPK		VPVAFDDVSI
YFSTPEWEKL		EEWQKELYKN		IMKGNYESLI		SMDYAINQPD		VLSQIQPEGE
HNTEDQAGPE		ESEIPTDPSE		EPGISTSDIL		SWIKQEEEPQ		VGAPPESKES
DVYKSTYADE		ELVIKAEGLA		RSSLCPEVPV		PFSSPPAAAK		DAFSDVAFKS
QQSTSMTPFG		RPATDLPEAS		EGQVTFTQLG		SYPLPPPVGE		QVFSCHHCGK
NLSQDMLLTH		QCSHATEHPL		PCAQCPKHFT		PQADLSSTSQ		DHASETPPTC
PHCARTFTHP		SRLTYHLRVH		NSTERPFPCP		DCPKRFADQA		RLTSHRRAHA
SERPFRCAQC		GRSFSLKISL		LLHQRGHAQE		RPFSCPQCGI		DFNGHSALIR
HQMIHTGERP		YPCTDCSKSF		MRKEHLLNHR		RLHTGERPFS		CPHCGKSFIR
KHHLMKHQRI		HTGERPYPCS		YCGRSFRYKQ		TLKDHLRSGH		NGGCGGDSDP
SGQPPNPPGP		LITGLETSGL		GVNTEGLETN		QWYGEGSGGG		VL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Див. також

• Хромосома 7