ZNF438

ZNF438
Ідентифікатори
Символи	ZNF438, bA330O11.1, zinc finger protein 438
Зовнішні ІД	MGI: 2444919 HomoloGene: 18695 GeneCards: ZNF438
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	220929	240186
Ensembl	ENSG00000183621	ENSMUSG00000050945
UniProt	Q7Z4V0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001143766 NM_001143767 NM_001143768 NM_001143769 NM_001143770 NM_001143771 NM_182755 NM_001387405 NM_001387411 NM_001387412	NM_178722 NM_001360447
RefSeq (білок)	NP_001137238 NP_001137239 NP_001137240 NP_001137241 NP_001137242 NP_001137243 NP_877432	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 10: 30.82 – 31.03 Mb	Хр. 18: 5.21 – 5.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF438 (англ. Zinc finger protein 438) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 91 836.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQNSVSVPPK		DEGESNIPSG		TIQSRKGLQN		KSQFRTIAPK		IVPKVLTSRM
LPCHSPSRSD		QVNLGPSINS		KLLGMSTQNY		ALMQVAGQEG		TFSLVALPHV
ASAQPIQKPR		MSLPENLKLP		IPRYQPPRNS		KASRKKPILI		FPKSGCSKAP
AQTQMCPQMS		PSPPHHPELL		YKPSPFEEVP		SLEQAPASIS		TAALTNGSDH
GDLRPPVTNT		HGSLNPPATP		ASSTPEEPAK		QDLTALSGKA		HFVSKITSSK
PSAVASEKFK		EQVDLAKTMT		NLSPTILGNA		VQLISSVPKG		KLPIPPYSRM
KTMEVYKIKS		DANIAGFSLP		GPKADCDKIP		STTEGFNAAT		KVASRLPVPQ
VSQQSACESA		FCPPTKLDLN		HKTKLNSGAA		KRKGRKRKVP		DEILAFQGKR
RKYIINKCRD		GKERVKNDPQ		EFRDQKLGTL		KKYRSIMPKP		IMVIPTLASL
ASPTTLQSQM		LGGLGQDVLL		NNSLTPKYLG		CKQDNSSSPK		PSSVFRNGFS
GIKKPWHRCH		VCNHHFQFKQ		HLRDHMNTHT		NRRPYSCRIC		RKSYVRPGSL
STHMKLHHGE		NRLKKLMCCE		FCAKVFGHIR		VYFGHLKEVH		RVVISTEPAP
SELQPGDIPK		NRDMSVRGME		GSLERENKSN		LEEDFLLNQA		DEVKLQIKCG
RCQITAQSFA		EIKFHLLDVH		GEEIEGRLQE		GTFPGSKGTQ		EELVQHASPD
WKRHPERGKP		EKVHSSSEES		HACPRLKRQL		HLHQNGVEML		MENEGPQSGT
NKPRETCQGP		ECPGLHTFLL		WSHSGFNCLL		CAEMLGRKED		LLHHWKHQHN
CEDPSKLWAI		LNTVSNQGVI		ELSSEAEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10