ZNF48

ZNF48
Ідентифікатори
Символи	ZNF48, ZNF553, zinc finger protein 48
Зовнішні ІД	MGI: 2384725 HomoloGene: 27098 GeneCards: ZNF48
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	197407	233887
Ensembl	ENSG00000180035	ENSMUSG00000045598
UniProt	Q96MX3	Q3US17
RefSeq (мРНК)	NM_152652 NM_001214906 NM_001214907 NM_001214909 NM_001324494	NM_146201 NM_001360912
RefSeq (білок)	NP_001201835 NP_001201836 NP_001201838 NP_001311423 NP_689865	NP_666313 NP_001347841
Локус (UCSC)	Хр. 16: 30.38 – 30.4 Mb	Хр. 7: 126.83 – 126.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF48 (англ. Zinc finger protein 48) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 618 амінокислот, а молекулярна маса — 67 820.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERAVEPWGP		DLHRPEEREP		QRGARTGLGS		ENVISQPNEF		EHTPQEDDLG
FKEEDLAPDH		EVGNASLKPE		GIQNWDDLWV		QREGLGKPQP		RDRGPRLLGE
PRWGQASSDR		AAVCGECGKS		FRQMSDLVKH		QRTHTGEKPY		KCGVCGKGFG
DSSARIKHQR		THSGEKPYRA		RPPAQGPPKI		PRSRIPAGER		PTICGECGKS
FRQSSDLVKH		QRTHTGEKPY		KCGICGKGFG		DSSARIKHQR		THRGEQPPRP
VVPRRQPSRA		ATAATQGPKA		QDKPYICTDC		GKRFVLSCSL		LSHQRSHLGP
KPFGCDVCGK		EFARGSDLVK		HLRVHTGEKP		YLCPECGKGF		ADSSARVKHL
RTHSGERPHA		CPECDRTFSL		SSTLLRHRLT		HMEPQDFSFP		GYPLPALIPS
PPPPPLGTSP		PLTPRSPSHS		GEPFGLPGLE		PEPGGPQAGE		PPPPLAGDKP
HKCPECGKGF		RRSSDLVKHH		RVHTGEKPYL		CPECGKGFAD		SSARVKHLRT
HRGERARPPP		PSTLLRPHNP		PGPVPMAPRP		RVRAQPSGPS		QPHVCGFCGK
EFPRSSDLVK		HRRTHTGEKP		YKCAECGKGF		GDSSARIKHQ		RGHLVLTPFG
IGDGRARPLK		QEAATGLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lichter P., Bray P., Ried T., Dawid I.B., Ward D.C. (1992). Clustering of C2-H2 zinc finger motif sequences within telomeric and fragile site regions of human chromosomes. Genomics. 13: 999—1007. PMID 1505991 DOI:10.1016/0888-7543(92)90013-I
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 16