ZNRF1

ZNRF1
Ідентифікатори
Символи	ZNRF1, NIN283, zinc and ring finger 1, E3 ubiquitin protein ligase, zinc and ring finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 612060 MGI: 2177308 HomoloGene: 41858 GeneCards: ZNRF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • ендосома • міжклітинні контакти • лізосома • синапс • synaptic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма Біологічний процес • protein K48-linked ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84937	170737
Ensembl	ENSG00000186187	ENSMUSG00000033545
UniProt	Q8ND25	Q91V17
RefSeq (мРНК)	NM_032268	NM_001168621 NM_001168622 NM_001168623 NM_133206 NM_001363488 NM_001363489
RefSeq (білок)	NP_115644	NP_001162092 NP_001162093 NP_001162094 NP_573469 NP_001350417 NP_001350418
Локус (UCSC)	Хр. 16: 75 – 75.11 Mb	Хр. 8: 112.26 – 112.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNRF1 (англ. Zinc and ring finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 227 амінокислот, а молекулярна маса — 23 783.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGKQSTAAR		SRGPFPGVST		DDSAVPPPGG		APHFGHYRTG		GGAMGLRSRS
VSSVAGMGMD		PSTAGGVPFG		LYTPASRGTG		DSERAPGGGG		SASDSTYAHG
NGYQETGGGH		HRDGMLYLGS		RASLADALPL		HIAPRWFSSH		SGFKCPICSK
SVASDEMEMH		FIMCLSKPRL		SYNDDVLTKD		AGECVICLEE		LLQGDTIARL
PCLCIYHKSC		IDSWFEVNRS		CPEHPAD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, синапсах, ендосомах.

Література

• Araki T., Nagarajan R., Milbrandt J. (2001). Identification of genes induced in peripheral nerve after injury. Expression profiling and novel gene discovery. J. Biol. Chem. 276: 34131—34141. PMID 11427537 DOI:10.1074/jbc.M104271200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Araki T., Milbrandt J. (2003). ZNRF proteins constitute a family of presynaptic E3 ubiquitin ligases. J. Neurosci. 23: 9385—9394. PMID 14561866

Див. також

• Хромосома 16