DROSHA

DROSHA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KHX, 5B16
Ідентифікатори
Символи	DROSHA, ETOHI2, HSA242976, RANSE3L, RN3, RNASE3L, RNASEN, drosha ribonuclease III
Зовнішні ІД	OMIM: 608828 MGI: 1261425 HomoloGene: 8293 GeneCards: DROSHA
Онтологія гена Молекулярна функція • ribonuclease III activity • protein homodimerization activity • lipopolysaccharide binding • зв'язування з іоном металу • endoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclease activity • endonuclease activity • hydrolase activity • RNA binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • SMAD binding • R-SMAD binding • primary miRNA binding • double-stranded RNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • microprocessor complex • ядерце • клітинне ядро • клітинна мембрана • focal adhesion • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • ribosome biogenesis • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • rRNA catabolic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • regulation of miRNA metabolic process • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing • регуляція експресії генів • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • regulation of regulatory T cell differentiation • RNA phosphodiester bond hydrolysis • regulation of inflammatory response • GO:0061715 miRNA metabolic process • Сайленсинг генів • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference • pre-miRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29102	14000
Ensembl	ENSG00000113360	ENSMUSG00000022191
UniProt	Q9NRR4	Q5HZJ0
RefSeq (мРНК)	NM_001100412 NM_013235 NM_001382508	NM_001130149 NM_026799
RefSeq (білок)	NP_001093882 NP_037367 NP_001369437	NP_001123621 NP_081075
Локус (UCSC)	Хр. 5: 31.4 – 31.53 Mb	Хр. 15: 12.82 – 12.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DROSHA (англ. Drosha ribonuclease III) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 374 амінокислот, а молекулярна маса — 159 316.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMQGNTCHRM		SFHPGRGCPR		GRGGHGARPS		APSFRPQNLR		LLHPQQPPVQ
YQYEPPSAPS		TTFSNSPAPN		FLPPRPDFVP		FPPPMPPSAQ		GPLPPCPIRP
PFPNHQMRHP		FPVPPCFPPM		PPPMPCPNNP		PVPGAPPGQG		TFPFMMPPPS
MPHPPPPPVM		PQQVNYQYPP		GYSHHNFPPP		SFNSFQNNPS		SFLPSANNSS
SPHFRHLPPY		PLPKAPSERR		SPERLKHYDD		HRHRDHSHGR		GERHRSLDRR
ERGRSPDRRR		QDSRYRSDYD		RGRTPSRHRS		YERSRERERE		RHRHRDNRRS
PSLERSYKKE		YKRSGRSYGL		SVVPEPAGCT		PELPGEIIKN		TDSWAPPLEI
VNHRSPSREK		KRARWEEEKD		RWSDNQSSGK		DKNYTSIKEK		EPEETMPDKN
EEEEEELLKP		VWIRCTHSEN		YYSSDPMDQV		GDSTVVGTSR		LRDLYDKFEE
ELGSRQEKAK		AARPPWEPPK		TKLDEDLESS		SESECESDED		STCSSSSDSE
VFDVIAEIKR		KKAHPDRLHD		ELWYNDPGQM		NDGPLCKCSA		KARRTGIRHS
IYPGEEAIKP		CRPMTNNAGR		LFHYRITVSP		PTNFLTDRPT		VIEYDDHEYI
FEGFSMFAHA		PLTNIPLCKV		IRFNIDYTIH		FIEEMMPENF		CVKGLELFSL
FLFRDILELY		DWNLKGPLFE		DSPPCCPRFH		FMPRFVRFLP		DGGKEVLSMH
QILLYLLRCS		KALVPEEEIA		NMLQWEELEW		QKYAEECKGM		IVTNPGTKPS
SVRIDQLDRE		QFNPDVITFP		IIVHFGIRPA		QLSYAGDPQY		QKLWKSYVKL
RHLLANSPKV		KQTDKQKLAQ		REEALQKIRQ		KNTMRREVTV		ELSSQGFWKT
GIRSDVCQHA		MMLPVLTHHI		RYHQCLMHLD		KLIGYTFQDR		CLLQLAMTHP
SHHLNFGMNP		DHARNSLSNC		GIRQPKYGDR		KVHHMHMRKK		GINTLINIMS
RLGQDDPTPS		RINHNERLEF		LGDAVVEFLT		SVHLYYLFPS		LEEGGLATYR
TAIVQNQHLA		MLAKKLELDR		FMLYAHGPDL		CRESDLRHAM		ANCFEALIGA
VYLEGSLEEA		KQLFGRLLFN		DPDLREVWLN		YPLHPLQLQE		PNTDRQLIET
SPVLQKLTEF		EEAIGVIFTH		VRLLARAFTL		RTVGFNHLTL		GHNQRMEFLG
DSIMQLVATE		YLFIHFPDHH		EGHLTLLRSS		LVNNRTQAKV		AEELGMQEYA
ITNDKTKRPV		ALRTKTLADL		LESFIAALYI		DKDLEYVHTF		MNVCFFPRLK
EFILNQDWND		PKSQLQQCCL		TLRTEGKEPD		IPLYKTLQTV		GPSHARTYTV
AVYFKGERIG		CGKGPSIQQA		EMGAAMDALE		KYNFPQMAHQ		KRFIERKYRQ
ELKEMRWERE		HQEREPDETE		DIKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

DROSHA за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі.

Література

• Wu H., Xu H., Miraglia L.J., Crooke S.T. (2000). Human RNase III is a 160-kDa protein involved in preribosomal RNA processing. J. Biol. Chem. 275: 36957—36965. PMID 10948199 DOI:10.1074/jbc.M005494200
• Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Landthaler M., Yalcin A., Tuschl T. (2004). The human DiGeorge syndrome critical region gene 8 and its D. melanogaster homolog are required for miRNA biogenesis. Curr. Biol. 14: 2162—2167. PMID 15589161 DOI:10.1016/j.cub.2004.11.001
• Zeng Y., Yi R., Cullen B.R. (2005). Recognition and cleavage of primary microRNA precursors by the nuclear processing enzyme Drosha. EMBO J. 24: 138—148. PMID 15565168 DOI:10.1038/sj.emboj.7600491
• Faller M., Matsunaga M., Yin S., Loo J.A., Guo F. (2007). Heme is involved in microRNA processing. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 23—29. PMID 17159994 DOI:10.1038/nsmb1182

Див. також

• Pasha
• Дайсер
• Хромосома 5