HLA-DQB2

HLA-DQB2
Ідентифікатори
Символи	HLA-DQB2, HLA-DQB1, HLA-DXB, major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2, DQB2
Зовнішні ІД	OMIM: 615161 GeneCards: HLA-DQB2
Пов'язані генетичні захворювання
гепатит B, лімфома
Онтологія гена Молекулярна функція • MHC class II receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • MHC class II protein complex • lysosomal membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • лізосома • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane Біологічний процес • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3120	368615
Ensembl	ENSG00000230675 ENSG00000196610 ENSG00000228254 ENSG00000232629 ENSG00000229493 ENSG00000228813 ENSG00000226165 ENSG00000224305	ENSDARG00000104635
UniProt	P05538	Q32Q47
RefSeq (мРНК)	NM_001198858 NM_001300790 NM_182549	NM_001007206
RefSeq (білок)	NP_001185787 NP_001287719	NP_001007207
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.76 – 32.76 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-DQB2 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 268 амінокислот, а молекулярна маса — 30 387.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSWKMALQIP		GGFWAAAVTV		MLVMLSTPVA		EARDFPKDFL		VQFKGMCYFT
NGTERVRGVA		RYIYNREEYG		RFDSDVGEFQ		AVTELGRSIE		DWNNYKDFLE
QERAAVDKVC		RHNYEAELRT		TLQRQVEPTV		TISPSRTEAL		NHHNLLVCSV
TDFYPAQIKV		RWFRNDQEET		AGVVSTSLIR		NGDWTFQILV		MLEITPQRGD
IYTCQVEHPS		LQSPITVEWR		AQSESAQSKM		LSGIGGFVLG		LIFLGLGLII
RHRGQKGPRG		PPPAGLLH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Berdoz J., Tiercy J.-M., Rollini P., Mach B., Gorski J. (1989). Remarkable sequence conservation of the HLA-DQB2 locus (DX beta) within the highly polymorphic DQ subregion of the human MHC. Immunogenetics. 29: 241—248. PMID 2564844 DOI:10.1007/BF00717908
• Cresswell P. (1996). Invariant chain structure and MHC class II function. Cell. 84: 505—507. PMID 8598037 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81025-9
• Villadangos J.A. (2001). Presentation of antigens by MHC class II molecules: getting the most out of them. Mol. Immunol. 38: 329—346. PMID 11684289 DOI:10.1016/S0161-5890(01)00069-4
• Rocha N., Neefjes J. (2008). MHC class II molecules on the move for successful antigen presentation. EMBO J. 27: 1—5. PMID 18046453 DOI:10.1038/sj.emboj.7601945
• Menendez-Benito V., Neefjes J. (2007). Autophagy in MHC class II presentation: sampling from within. Immunity. 26: 1—3. PMID 17241953 DOI:10.1016/j.immuni.2007.01.005

Див. також

• Хромосома 6