OTP

OTP
Ідентифікатори
Символи	OTP, orthopedia homeobox
Зовнішні ІД	OMIM: 604529 MGI: 99835 HomoloGene: 7874 GeneCards: OTP
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development • positive regulation of neuroblast proliferation • hypothalamus cell differentiation • диференціація клітин • neurohypophysis development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • forebrain neuron differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23440	18420
Ensembl	ENSG00000171540	ENSMUSG00000021685
UniProt	Q5XKR4	O09113
RefSeq (мРНК)	NM_032109	NM_011021
RefSeq (білок)	NP_115485	NP_035151
Локус (UCSC)	Хр. 5: 77.63 – 77.64 Mb	Хр. 13: 95.01 – 95.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTP (англ. Orthopedia homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 34 159.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSHADLLDA		RLGMKDAAEL		LGHREAVKCR		LGVGGSDPGG		HPGDLAPNSD
PVEGATLLPG		EDITTVGSTP		ASLAVSAKDP		DKQPGPQGGP		NPSQAGQQQG
QQKQKRHRTR		FTPAQLNELE		RSFAKTHYPD		IFMREELALR		IGLTESRVQV
WFQNRRAKWK		KRKKTTNVFR		APGTLLPTPG		LPQFPSAAAA		AAAAMGDSLC
SFHANDTRWA		AAAMPGVSQL		PLPPALGRQQ		AMAQSLSQCS		LAAGPPPNSM
GLSNSLAGSN		GAGLQSHLYQ		PAFPGMVPAS		LPGPSNVSGS		PQLCSSPDSS
DVWRGTSIAS		LRRKALEHTV		SMSFT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5