TYMS

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
TYMS
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TYMS, HST422, TMS, TS, thymidylate synthetase
Зовнішні ІД OMIM: 188350 MGI: 98878 HomoloGene: 834 GeneCards: TYMS
Реагує на сполуку
Капецитабін, pemetrexed, raltitrexed[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001071
NM_001354867
NM_001354868
NM_021288
RefSeq (білок)
NP_001062
NP_001341796
NP_001341797
NP_001062.1
NP_067263
Локус (UCSC) Хр. 18: 0.66 – 0.67 Mb Хр. 5: 30.26 – 30.28 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TYMS (англ. Thymidylate synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 35 716[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPVAGSELPRRPLPPAAQERDAEPRPPHGELQYLGQIQHILRCGVRKDDR
TGTGTLSVFGMQARYSLRDEFPLLTTKRVFWKGVLEELLWFIKGSTNAKE
LSSKGVKIWDANGSRDFLDSLGFSTREEGDLGPVYGFQWRHFGAEYRDME
SDYSGQGVDQLQRVIDTIKTNPDDRRIIMCAWNPRDLPLMALPPCHALCQ
FYVVNSELSCQLYQRSGDMGLGVPFNIASYALLTYMIAHITGLKPGDFIH
TLGDAHIYLNHIEPLKIQLQREPRPFPKLRILRKVEKIDDFKAEDFQIEG
YNPHPTIKMEMAV

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Anderson D.D., Quintero C.M., Stover P.J. (2011). Identification of a de novo thymidylate biosynthesis pathway in mammalian mitochondria. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 15163—15168. PMID 21876188 DOI:10.1073/pnas.1103623108
  • Schiffer C.A., Clifton I.J., Davisson V.J., Santi D.V., Stroud R.M. (1995). Crystal structure of human thymidylate synthase: a structural mechanism for guiding substrates into the active site. Biochemistry. 34: 16279—16287. PMID 8845352 DOI:10.1021/bi00050a007
  • Shimizu K., Ayusawa D., Takeishi K., Seno T. (1985). Purification and NH2-terminal amino acid sequence of human thymidylate synthase in an overproducing transformant of mouse FM3A cells. J. Biochem. 97: 845—850. PMID 3839505
  • Davisson V.J., Sirawaraporn W., Santi D.V. (1989). Expression of human thymidylate synthase in Escherichia coli. J. Biol. Chem. 264: 9145—9148. PMID 2656695

Примітки

Див. також