ADARB1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
ADARB1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ADARB1, ADAR2, DRABA2, DRADA2, RED1, adenosine deaminase, RNA specific B1, adenosine deaminase RNA specific B1, NEDHYMS
Зовнішні ІД OMIM: 601218 MGI: 891999 HomoloGene: 8280 GeneCards: ADARB1
шифр КФ 3.5.4.37
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001024837
NM_001024838
NM_001024839
NM_001024840
NM_130895
RefSeq (білок)
NP_001020008
NP_570965
NP_001020009
Локус (UCSC) Хр. 21: 45.07 – 45.23 Mb Хр. 10: 77.13 – 77.25 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ADARB1 (англ. Adenosine deaminase, RNA specific B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 80 763[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPG
RKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQ
TGPVHAPLFVMSVEVNGQVFEGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASE
AHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSF
SSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYD
FLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH
LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRK
VLAGVVMTTGTDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISR
RSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSP
CGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSDPSTSTFQ
GAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGER
LLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM
YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIE
VINATTGKDELGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHE
SKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, процесінг мРНК, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.


У мозку миші в ході ембріонального розвитку активність білку зростає. Особливо висока його кількість у таламусі. Активність білка посилюють імпортин KPNA3, який транспортує його в ядро з цитоплазми, та ізомераза PIN1, що стабілізує фермент у ядрі[5].

Література

[ред. | ред. код]
  • Lai F., Chen C.-X., Carter K.C., Nishikura K. (1997). Editing of glutamate receptor B subunit ion channel RNAs by four alternatively spliced DRADA2 double-stranded RNA adenosine deaminases. Mol. Cell. Biol. 17: 2413—2424. PMID 9111310 DOI:10.1128/MCB.17.5.2413
  • Villard L., Tassone F., Haymowicz M., Welborn R., Gardiner K. (1997). Map location, genomic organization and expression patterns of the human RED1 RNA editase. Somat. Cell Mol. Genet. 23: 135—145. PMID 9330641 DOI:10.1007/BF02679972
  • Slavov D., Gardiner K. (2002). Phylogenetic comparison of the pre-mRNA adenosine deaminase ADAR2 genes and transcripts: conservation and diversity in editing site sequence and alternative splicing patterns. Gene. 299: 83—94. PMID 12459255 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01016-8
  • Kawahara Y., Ito K., Ito M., Tsuji S., Kwak S. (2005). Novel splice variants of human ADAR2 mRNA: skipping of the exon encoding the dsRNA-binding domains, and multiple C-terminal splice sites. Gene. 363: 193—201. PMID 16297572 DOI:10.1016/j.gene.2005.07.028
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Maas S., Gommans W.M. (2009). Novel exon of mammalian ADAR2 extends open reading frame. PLoS ONE. 4: E4225—E4225. PMID 19156214 DOI:10.1371/journal.pone.0004225

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:226 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  4. UniProt, P78563 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  5. Lundin, Elin; Wu, Chenglin; Widmark, Albin; Behm, Mikaela; Hjerling-Leffler, Jens; Daniel, Chammiran; Öhman, Marie; Nilsson, Mats (2020). Spatiotemporal mapping of RNA editing in the developing mouse brain using in situ sequencing reveals regional and cell-type-specific regulation. BMC Biology. 18 (1). doi:10.1186/s12915-019-0736-3. ISSN 1741-7007.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)(англ.)

Див. також

[ред. | ред. код]