AEBP2

AEBP2
Ідентифікатори
Символи	AEBP2, AE binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 617934 MGI: 1338038 HomoloGene: 40690 GeneCards: AEBP2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • ESC/E(Z) complex • нуклеоплазма Біологічний процес • negative regulation of gene expression, epigenetic • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	121536	11569
Ensembl	ENSG00000139154	ENSMUSG00000030232
UniProt	Q6ZN18	Q9Z248
RefSeq (мРНК)	NM_001114176 NM_001267043 NM_153207 NM_001363736	NM_001005605 NM_009637 NM_178803 NM_001309436 NM_001309437
RefSeq (білок)	NP_001107648 NP_001253972 NP_694939 NP_001350665	NP_001005605 NP_001296365 NP_001296366 NP_033767 NP_848918
Локус (UCSC)	Хр. 12: 19.4 – 19.72 Mb	Хр. 6: 140.57 – 140.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AEBP2 (англ. AE binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 517 амінокислот, а молекулярна маса — 54 467.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAITDMAD		LEELSRLSPL		PPGSPGSAAR		GRAEPPEEEE		EEEEEEEEAE
AEAVAALLLN		GGSGGGGGGG		GGGVGGGEAE		TMSEPSPESA		SQAGEDEDEE
EDDEEEEDES		SSSGGGEEES		SAESLVGSSG		GSSSDETRSL		SPGAASSSSG
DGDGKEGLEE		PKGPRGSQGG		GGGGSSSSSV		VSSGGDEGYG		TGGGGSSATS
GGRRGSLEMS		SDGEPLSRMD		SEDSISSTIM		DVDSTISSGR		STPAMMNGQG
STTSSSKNIA		YNCCWDQCQA		CFNSSPDLAD		HIRSIHVDGQ		RGGVFVCLWK
GCKVYNTPST		SQSWLQRHML		THSGDKPFKC		VVGGCNASFA		SQGGLARHVP
THFSQQNSSK		VSSQPKAKEE		SPSKAGMNKR		RKLKNKRRRS		LPRPHDFFDA
QTLDAIRHRA		ICFNLSAHIE		SLGKGHSVVF		HSTVIAKRKE		DSGKIKLLLH
WMPEDILPDV		WVNESERHQL		KTKVVHLSKL		PKDTALLLDP		NIYRTMPQKR
LKRTLIRKVF		NLYLSKQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cao R., Zhang Y. (2004). SUZ12 is required for both the histone methyltransferase activity and the silencing function of the EED-EZH2 complex. Mol. Cell. 15: 57—67. PMID 15225548 DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.020

Див. також

• Хромосома 12