AGAP2

AGAP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2BMJ, 2IWR, 2RLO
Ідентифікатори
Символи	AGAP2, CENTG1, GGAP2, PIKE, ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605476 HomoloGene: 86815 GeneCards: AGAP2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • зв'язування з іоном металу • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • екзосома • мембрана • ядерце • цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро Біологічний процес • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • protein transport • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0015915 транспорт • positive regulation of 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116986	65218
Ensembl	ENSG00000135439	ENSRNOG00000025584
UniProt	Q99490	Q8CGU4
RefSeq (мРНК)	NM_001122772 NM_014770	NM_023026
RefSeq (білок)	NP_001116244 NP_055585	NP_075415
Локус (UCSC)	Хр. 12: 57.72 – 57.74 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AGAP2 (англ. ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 192 амінокислот, а молекулярна маса — 124 674.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRGAGALQR		RTTTYLISLT		LVKLESVPPP		PPSPSAAAVG		APGARGSEPR
DPGSPRGAEE		PGKKRHERLF		HRQDALWIST		SSAGAGGAEP		PALSPAPASP
ARPVSPAPGR		RLSLWAAPPG		PPLSGGLSPD		SKPGGAPSSS		RRPLLSSPSW
GGPEPEGRTG		GGVPGSSSPH		PGTGSRRLKV		APPPPAPKPC		KTVTTSGAKA
GGGKGAGSRL		SWPESEGKPR		VKGSKSSAGT		GASVSAAATA		AAAGGGGSTA
STSGGVGAGA		GARGKLSPRK		GKSKTLDNSD		LHPGPPAGSP		PPLTLPPTPS
PATAVTAASA		QPPGPAPPIT		LEPPAPGLKR		GREGGRASTR		DRKMLKFISG
IFTKSTGGPP		GSGPLPGPPS		LSSGSGSREL		LGAELRASPK		AVINSQEWTL
SRSIPELRLG		VLGDARSGKS		SLIHRFLTGS		YQVLEKTESE		QYKKEMLVDG
QTHLVLIREE		AGAPDAKFSG		WADAVIFVFS		LEDENSFQAV		SRLHGQLSSL
RGEGRGGLAL		ALVGTQDRIS		ASSPRVVGDA		RARALCADMK		RCSYYETCAT
YGLNVDRVFQ		EVAQKVVTLR		KQQQLLAACK		SLPSSPSHSA		ASTPVAGQAS
NGGHTSDYSS		SLPSSPNVGH		RELRAEAAAV		AGLSTPGSLH		RAAKRRTSLF
ANRRGSDSEK		RSLDSRGETT		GSGRAIPIKQ		SFLLKRSGNS		LNKEWKKKYV
TLSSNGFLLY		HPSINDYIHS		THGKEMDLLR		TTVKVPGKRP		PRAISAFGPS
ASINGLVKDM		STVQMGEGLE		ATTPMPSPSP		SPSSLQPPPD		QTSKHLLKPD
RNLARALSTD		CTPSGDLSPL		SREPPPSPMV		KKQRRKKLTT		PSKTEGSAGQ
AEAKRKMWKL		KSFGSLRNIY		KAEENFEFLI		VSSTGQTWHF		EAASFEERDA
WVQAIESQIL		ASLQCCESSK		VKLRTDSQSE		AVAIQAIRNA		KGNSICVDCG
APNPTWASLN		LGALICIECS		GIHRNLGTHL		SRVRSLDLDD		WPRELTLVLT
AIGNDTANRV		WESDTRGRAK		PSRDSSREER		ESWIRAKYEQ		LLFLAPLSTS
EEPLGRQLWA		AVQAQDVATV		LLLLAHARHG		PLDTSVEDPQ		LRSPLHLAAE
LAHVVITQLL		LWYGADVAAR		DAQGRTALFY		ARQAGSQLCA		DILLQHGCPG
EGGSAATTPS		AATTPSITAT		PSPRRRSSAA		SVGRADAPVA		LV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ahn J.-Y., Hu Y., Kroll T.G., Allard P., Ye K. (2004). PIKE-A is amplified in human cancers and prevents apoptosis by up-regulating Akt. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 6993—6998. PMID 15118108 DOI:10.1073/pnas.0400921101
• Nie Z., Fei J., Premont R.T., Randazzo P.A. (2005). The Arf GAPs AGAP1 and AGAP2 distinguish between the adaptor protein complexes AP-1 and AP-3. J. Cell Sci. 118: 3555—3566. PMID 16079295 DOI:10.1242/jcs.02486
• Knobbe C.B., Trampe-Kieslich A., Reifenberger G. (2005). Genetic alteration and expression of the phosphoinositol-3-kinase/Akt pathway genes PIK3CA and PIKE in human glioblastomas. Neuropathol. Appl. Neurobiol. 31: 486—490. PMID 16150119 DOI:10.1111/j.1365-2990.2005.00660.x
• Tang X., Feng Y., Ye K. (2007). Src-family tyrosine kinase fyn phosphorylates phosphatidylinositol 3-kinase enhancer-activating Akt, preventing its apoptotic cleavage and promoting cell survival. Cell Death Differ. 14: 368—377. PMID 16841086 DOI:10.1038/sj.cdd.4402011

Див. також

• Хромосома 12