AGFG1

AGFG1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D9L, 2OLM, 2VX8
Ідентифікатори
Символи	AGFG1, HRB, RAB, RIP, ArfGAP with FG repeats 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600862 MGI: 1333754 HomoloGene: 37929 GeneCards: AGFG1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • cell projection • внутрішньоклітинна мембранна органела • Ядерна пора • neuronal cell body • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • intermediate filament organization • диференціація клітин • mRNA transport • mRNA export from nucleus • multicellular organism development • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • acrosome assembly • Сперматогенез • spermatid nucleus differentiation • membrane organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3267	15463
Ensembl	ENSG00000173744	ENSMUSG00000026159
UniProt	P52594	Q8K2K6
RefSeq (мРНК)	NM_001135187 NM_001135188 NM_001135189 NM_004504	NM_010472 NM_001310713 NM_001347077 NM_001368850
RefSeq (білок)	NP_001128659 NP_001128660 NP_001128661 NP_004495	NP_001297642 NP_001334006 NP_034602 NP_001355779
Локус (UCSC)	Хр. 2: 227.47 – 227.56 Mb	Хр. 1: 82.82 – 82.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AGFG1 (англ. ArfGAP with FG repeats 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 562 амінокислот, а молекулярна маса — 58 260.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASAKRKQE		EKHLKMLRDM		TGLPHNRKCF		DCDQRGPTYV		NMTVGSFVCT
SCSGSLRGLN		PPHRVKSISM		TTFTQQEIEF		LQKHGNEVCK		QIWLGLFDDR
SSAIPDFRDP		QKVKEFLQEK		YEKKRWYVPP		EQAKVVASVH		ASISGSSASS
TSSTPEVKPL		KSLLGDSAPT		LHLNKGTPSQ		SPVVGRSQGQ		QQEKKQFDLL
SDLGSDIFAA		PAPQSTATAN		FANFAHFNSH		AAQNSANADF		ANFDAFGQSS
GSSNFGGFPT		ASHSPFQPQT		TGGSAASVNA		NFAHFDNFPK		SSSADFGTFN
TSQSHQTASA		VSKVSTNKAG		LQTADKYAAL		ANLDNIFSAG		QGGDQGSGFG
TTGKAPVGSV		VSVPSQSSAS		SDKYAALAEL		DSVFSSAATS		SNAYTSTSNA
SSNVFGTVPV		VASAQTQPAS		SSVPAPFGAT		PSTNPFVAAA		GPSVASSTNP
FQTNARGATA		ATFGTASMSM		PTGFGTPAPY		SLPTSFSGSF		QQPAFPAQAA
FPQQTAFSQQ		PNGAGFAAFG		QTKPVVTPFG		QVAAAGVSSN		PFMTGAPTGQ
FPTGSSSTNP		FL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт мРНК, диференціація, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Bogerd H.P., Fridell R.A., Madore S., Cullen B.R. (1995). Identification of a novel cellular cofactor for the Rev/Rex class of retroviral regulatory proteins. Cell. 82: 485—494. PMID 7634337 DOI:10.1016/0092-8674(95)90437-9
• Fritz C.C., Zapp M.L., Green M.R. (1995). A human nucleoporin-like protein that specifically interacts with HIV Rev. Nature. 376: 530—533. PMID 7637788 DOI:10.1038/376530a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sanchez-Velar N., Udofia E.B., Yu Z., Zapp M.L. (2004). hRIP, a cellular cofactor for Rev function, promotes release of HIV RNAs from the perinuclear region. Genes Dev. 18: 23—34. PMID 14701878 DOI:10.1101/gad.1149704

Див. також

• Хромосома 2