AKNA

AKNA
Ідентифікатори
Символи	AKNA, AT-hook transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 605729 MGI: 2140340 HomoloGene: 49947 GeneCards: AKNA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • мембрана • клітинне ядро • fibrillar center • нуклеоплазма • центросома • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • Центріоль • мікротрубочка • цитоплазма • цитоскелет Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • Епітеліально-мезенхімальний перехід • neuroblast division in subventricular zone • regulation of inflammatory response • delamination • neuroblast delamination • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80709	100182
Ensembl	ENSG00000106948	ENSMUSG00000039158
UniProt	Q7Z591	Q80VW7
RefSeq (мРНК)	NM_030767 NM_001317950 NM_001317952	NM_001045514 NM_001305432
RefSeq (білок)	NP_001304879 NP_001304881 NP_110394	NP_001038979 NP_001292361
Локус (UCSC)	Хр. 9: 114.33 – 114.39 Mb	Хр. 4: 63.37 – 63.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AKNA (англ. AT-hook transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 439 амінокислот, а молекулярна маса — 155 139.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSETEIRW		AEPGLGKGPQ		RRRWAWAEDK		RDVDRSSSQS		WEEERLFPNA
TSPELLEDFR		LAQQHLPPLE		WDPHPQPDGH		QDSESGETSG		EEAEAEDVDS
PASSHEPLAW		LPQQGRQLDM		TEEEPDGTLG		SLEVEEAGES		SSRLGYEAGL
SLEGHGNTSP		MALGHGQARG		WVASGEQASG		DKLSEHSEVN		PSVELSPARS
WSSGTVSLDH		PSDSLDSTWE		GETDGPQPTA		LAETLPEGPS		HHLLSPDGRT
GGSVARATPM		EFQDSSAPPA		QSPQHATDRW		RRETTRFFCP		QPKEHIWKQT
KTSPKPLPSR		FIGSISPLNP		QPRPTRQGRP		LPRQGATLAG		RSSSNAPKYG
RGQLNYPLPD		FSKVGPRVRF		PKDESYRPPK		SRSHNRKPQA		PARPLIFKSP
AEIVQEVLLS		SGEAALAKDT		PPAHPITRVP		QEFQTPEQAT		ELVHQLQEDY
HRLLTKYAEA		ENTIDQLRLG		AKVNLFSDPP		QPNHSIHTGM		VPQGTKVLSF
TIPQPRSAEW		WPGPAEDPQA		SAASGWPSAR		GDLSPSSLTS		MPTLGWLPEN
RDISEDQSSA		EQTQALASQA		SQFLAKVESF		ERLIQAGRLM		PQDQVKGFQR
LKAAHAALEE		EYLKACREQH		PAQPLAGSKG		TPGRFDPRRE		LEAEIYRLGS
CLEELKEHID		QTQQEPEPPG		SDSALDSTPA		LPCLHQPTHL		PAPSGQAPMP
AIKTSCPEPA		TTTAAASTGP		CPLHVNVEVS		SGNSEVEDRP		QDPLARLRHK
ELQMEQVYHG		LMERYLSVKS		LPEAMRMEEE		EEGEEEEEEE		GGGDSLEVDG
VAATPGKAEA		TRVLPRQCPV		QAEKSHGAPL		EEATEKMVSM		KPPGFQASLA
RDGHMSGLGK		AEAAPPGPGV		PPHPPGTKSA		ASHQSSMTSL		EGSGISERLP
QKPLHRGGGP		HLEETWMASP		ETDSGFVGSE		TSRVSPLTQT		PEHRLSHIST
AGTLAQPFAA		SVPRDGASYP		KARGSLIPRR		ATEPSTPRSQ		AQRYLSSPSG
PLRQRAPNFS		LERTLAAEMA		VPGSEFEGHK		RISEQPLPNK		TISPPPAPAP
AAAPLPCGPT		ETIPSFLLTR		AGRDQAICEL		QEEVSRLRLR		LEDSLHQPLQ
GSPTRPASAF		DRPARTRGRP		ADSPATWGSH		YGSKSTERLP		GEPRGEEQIV
PPGRQRARSS		SVPREVLRLS		LSSESELPSL		PLFSEKSKTT		KDSPQAARDG
KRGVGSAGWP		DRVTFRGQYT		GHEYHVLSPK		AVPKGNGTVS		CPHCRPIRTQ
DAGGAVTGDP		LGPPPADTLQ		CPLCGQVGSP		PEADGPGSAT		SGAEKATTRR
KASSTPSPKQ		RSKQAGSSPR		PPPGLWYLAT		APPAPAPPAF		AYISSVPIMP
YPPAAVYYAP		AGPTSAQPAA		KWPPTASPPP		ARRHRHSIQL		DLGDLEELNK
ALSRAVQAAE		SVRSTTRQMR		SSLSADLRQA		HSLRGSCLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9