APBB1

APBB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E45, 2HO2, 2IDH, 3D8D, 3D8E, 3D8F, 3DXC, 3DXD, 3DXE
Ідентифікатори
Символи	APBB1, amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 (Fe65), FE65, MGC:9072, RIR, amyloid beta precursor protein binding family B member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602709 MGI: 107765 HomoloGene: 898 GeneCards: APBB1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0031493 histone binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tau protein binding • proline-rich region binding • transcription factor binding • amyloid-beta binding • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • postsynaptic membrane • nuclear speck • cell projection • мембрана • dendritic spine • синапс • main axon • нуклеоплазма • growth cone lamellipodium • neuronal cell body • perinuclear region of cytoplasm • growth cone filopodium • presynaptic membrane • lamellipodium • клітинна мембрана • цитоплазма • growth cone • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex • presynapse Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • аксоноґенеза • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • transcription, DNA-templated • response to iron ion • negative regulation of cell growth • positive regulation of protein secretion • positive regulation of neuron projection development • positive regulation of apoptotic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0097285 апоптоз • histone H4 acetylation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	322	11785
Ensembl	ENSG00000166313	ENSMUSG00000037032
UniProt	O00213	Q9QXJ1
RefSeq (мРНК)	NM_001164 NM_001257319 NM_001257320 NM_001257321 NM_001257322 NM_001257323 NM_001257324 NM_001257325 NM_001257326 NM_145689	NM_001253885 NM_001253886 NM_001253887 NM_009685 NM_001310600
RefSeq (білок)	NP_001155 NP_001244248 NP_001244249 NP_001244250 NP_001244252 NP_001244254 NP_001244255 NP_663722	NP_001240814 NP_001240815 NP_001240816 NP_001297529 NP_033815
Локус (UCSC)	Хр. 11: 6.4 – 6.42 Mb	Хр. 7: 105.21 – 105.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

APBB1 (англ. Amyloid beta precursor protein binding family B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 710 амінокислот, а молекулярна маса — 77 244.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVPSSLSQS		AINANSHGGP		ALSLPLPLHA		AHNQLLNAKL		QATAVGPKDL
RSAMGEGGGP		EPGPANAKWL		KEGQNQLRRA		ATAHRDQNRN		VTLTLAEEAS
QEPEMAPLGP		KGLIHLYSEL		ELSAHNAANR		GLRGPGLIIS		TQEQGPDEGE
EKAAGEAEEE		EEDDDDEEEE		EDLSSPPGLP		EPLESVEAPP		RPQALTDGPR
EHSKSASLLF		GMRNSAASDE		DSSWATLSQG		SPSYGSPEDT		DSFWNPNAFE
TDSDLPAGWM		RVQDTSGTYY		WHIPTGTTQW		EPPGRASPSQ		GSSPQEESQL
TWTGFAHGEG		FEDGEFWKDE		PSDEAPMELG		LKEPEEGTLT		FPAQSLSPEP
LPQEEEKLPP		RNTNPGIKCF		AVRSLGWVEM		TEEELAPGRS		SVAVNNCIRQ
LSYHKNNLHD		PMSGGWGEGK		DLLLQLEDET		LKLVEPQSQA		LLHAQPIISI
RVWGVGRDSG		RERDFAYVAR		DKLTQMLKCH		VFRCEAPAKN		IATSLHEICS
KIMAERRNAR		CLVNGLSLDH		SKLVDVPFQV		EFPAPKNELV		QKFQVYYLGN
VPVAKPVGVD		VINGALESVL		SSSSREQWTP		SHVSVAPATL		TILHQQTEAV
LGECRVRFLS		FLAVGRDVHT		FAFIMAAGPA		SFCCHMFWCE		PNAASLSEAV
QAACMLRYQK		CLDARSQAST		SCLPAPPAES		VARRVGWTVR		RGVQSLWGSL
KPKRLGAHTP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Domingues S.C., Henriques A.G., Fardilha M., da Cruz E Silva E.F., da Cruz E Silva O.A. (2011). Identification and characterization of a neuronal enriched novel transcript encoding the previously described p60Fe65 isoform. J. Neurochem. 119: 1086—1098. PMID 21824145 DOI:10.1111/j.1471-4159.2011.07420.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee E.J., Hyun S.H., Chun J., Kang S.S. (2007). Human NIMA-related kinase 6 is one of the Fe65 WW domain binding proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 358: 783—788. PMID 17512906 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.04.203
• Nakaya T., Kawai T., Suzuki T. (2008). Regulation of FE65 nuclear translocation and function by amyloid beta-protein precursor in osmotically stressed cells. J. Biol. Chem. 283: 19119—19131. PMID 18468999 DOI:10.1074/jbc.M801827200
• Meiyappan M., Birrane G., Ladias J.A.A. (2007). Structural basis for polyproline recognition by the FE65 WW domain. J. Mol. Biol. 372: 970—980. PMID 17686488 DOI:10.1016/j.jmb.2007.06.064

Див. також

• Хромосома 11