BARX2

BARX2
Ідентифікатори
Символи	BARX2, BARX homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604823 MGI: 109617 HomoloGene: 2715 GeneCards: BARX2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • myotube differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cartilage condensation • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • гістогенез • animal organ development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8538	12023
Ensembl	ENSG00000043039	ENSMUSG00000032033
UniProt	Q9UMQ3	O08686
RefSeq (мРНК)	NM_003658	NM_013800
RefSeq (білок)	NP_003649	NP_038828
Локус (UCSC)	Хр. 11: 129.38 – 129.45 Mb	Хр. 9: 31.76 – 31.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BARX2 (англ. BARX homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 279 амінокислот, а молекулярна маса — 31 188.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHCHAELRLS		SPGQLKAARR		RYKTFMIDEI		LSKETCDYFE		KLSLYSVCPS
LVVRPKPLHS		CTGSPSLRAY		PLLSVITRQP		TVISHLVPAT		PGIAQALSCH
QVTEAVSAEA		PGGEALASSE		SETEQPTPRQ		KKPRRSRTIF		TELQLMGLEK
KFQKQKYLST		PDRLDLAQSL		GLTQLQVKTW		YQNRRMKWKK		MVLKGGQEAP
TKPKGRPKKN		SIPTSEEIEA		EEKMNSQAQG		QEQLEPSQGQ		EELCEAQEPK
ARDVPLEMAE		PPDPPQELPI		PSSEPPPLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hjalt T.A., Murray J.C. (1999). The human BARX2 gene: genomic structure, chromosomal localization, and single nucleotide polymorphisms. Genomics. 62: 456—459. PMID 10644443 DOI:10.1006/geno.1999.6037
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11