BAZ2A

BAZ2A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4LZ2, 4Q6F, 4QBM, 4QF2, 5AGQ
Ідентифікатори
Символи	BAZ2A, TIP5, WALp3, bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A
Зовнішні ІД	OMIM: 605682 MGI: 2151152 HomoloGene: 8393 GeneCards: BAZ2A
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001187 RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0031493 histone binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • lysine-acetylated histone binding • RNA binding Клітинна компонента • rDNA heterochromatin • chromatin silencing complex • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • Ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Метилювання ДНК • rDNA heterochromatin assembly • histone deacetylation • RNA polymerase I preinitiation complex assembly • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11176	116848
Ensembl	ENSG00000076108	ENSMUSG00000040054
UniProt	Q9UIF9	Q91YE5
RefSeq (мРНК)	NM_001300905 NM_013449 NM_001351156	NM_054078
RefSeq (білок)	NP_001287834 NP_038477 NP_001338085	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 56.6 – 56.64 Mb	Хр. 10: 127.93 – 127.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BAZ2A (англ. Bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 905 амінокислот, а молекулярна маса — 211 198.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEMEANDHFN		FTGLPPAPAA		SGLKPSPSSG		EGLYTNGSPM		NFPQQGKSLN
GDVNVNGLST		VSHTTTSGIL		NSAPHSSSTS		HLHHPSVAYD		CLWNYSQYPS
ANPGSNLKDP		PLLSQFSGGQ		YPLNGILGGS		RQPSSPSHNT		NLRAGSQEFW
ANGTQSPMGL		NFDSQELYDS		FPDQNFEVMP		NGPPSFFTSP		QTSPMLGSSI
QTFAPSQEVG		SGIHPDEAAE		KEMTSVVAEN		GTGLVGSLEL		EEEQPELKMC
GYNGSVPSVE		SLHQEVSVLV		PDPTVSCLDD		PSHLPDQLED		TPILSEDSLE
PFNSLAPEPV		SGGLYGIDDT		ELMGAEDKLP		LEDSPVISAL		DCPSLNNATA
FSLLADDSQT		STSIFASPTS		PPVLGESVLQ		DNSFDLNNGS		DAEQEEMETQ
SSDFPPSLTQ		PAPDQSSTIQ		LHPATSPAVS		PTTSPAVSLV		VSPAASPEIS
PEVCPAASTV		VSPAVFSVVS		PASSAVLPAV		SLEVPLTASV		TSPKASPVTS
PAAAFPTASP		ANKDVSSFLE		TTADVEEITG		EGLTASGSGD		VMRRRIATPE
EVRLPLQHGW		RREVRIKKGS		HRWQGETWYY		GPCGKRMKQF		PEVIKYLSRN
VVHSVRREHF		SFSPRMPVGD		FFEERDTPEG		LQWVQLSAEE		IPSRIQAITG
KRGRPRNTEK		AKTKEVPKVK		RGRGRPPKVK		ITELLNKTDN		RPLKKLEAQE
TLNEEDKAKI		AKSKKKMRQK		VQRGECQTTI		QGQARNKRKQ		ETKSLKQKEA
KKKSKAEKEK		GKTKQEKLKE		KVKREKKEKV		KMKEKEEVTK		AKPACKADKT
LATQRRLEER		QRQQMILEEM		KKPTEDMCLT		DHQPLPDFSR		VPGLTLPSGA
FSDCLTIVEF		LHSFGKVLGF		DPAKDVPSLG		VLQEGLLCQG		DSLGEVQDLL
VRLLKAALHD		PGFPSYCQSL		KILGEKVSEI		PLTRDNVSEI		LRCFLMAYGV
EPALCDRLRT		QPFQAQPPQQ		KAAVLAFLVH		ELNGSTLIIN		EIDKTLESMS
SYRKNKWIVE		GRLRRLKTVL		AKRTGRSEVE		MEGPEECLGR		RRSSRIMEET
SGMEEEEEEE		SIAAVPGRRG		RRDGEVDATA		SSIPELERQI		EKLSKRQLFF
RKKLLHSSQM		LRAVSLGQDR		YRRRYWVLPY		LAGIFVEGTE		GNLVPEEVIK
KETDSLKVAA		HASLNPALFS		MKMELAGSNT		TASSPARARG		RPRKTKPGSM
QPRHLKSPVR		GQDSEQPQAQ		LQPEAQLHAP		AQPQPQLQLQ		LQSHKGFLEQ
EGSPLSLGQS		QHDLSQSAFL		SWLSQTQSHS		SLLSSSVLTP		DSSPGKLDPA
PSQPPEEPEP		DEAESSPDPQ		ALWFNISAQM		PCNAAPTPPP		AVSEDQPTPS
PQQLASSKPM		NRPSAANPCS		PVQFSSTPLA		GLAPKRRAGD		PGEMPQSPTG
LGQPKRRGRP		PSKFFKQMEQ		RYLTQLTAQP		VPPEMCSGWW		WIRDPEMLDA
MLKALHPRGI		REKALHKHLN		KHRDFLQEVC		LRPSADPIFE		PRQLPAFQEG
IMSWSPKEKT		YETDLAVLQW		VEELEQRVIM		SDLQIRGWTC		PSPDSTREDL
AYCEHLSDSQ		EDITWRGRGR		EGLAPQRKTT		NPLDLAVMRL		AALEQNVERR
YLREPLWPTH		EVVLEKALLS		TPNGAPEGTT		TEISYEITPR		IRVWRQTLER
CRSAAQVCLC		LGQLERSIAW		EKSVNKVTCL		VCRKGDNDEF		LLLCDGCDRG
CHIYCHRPKM		EAVPEGDWFC		TVCLAQQVEG		EFTQKPGFPK		RGQKRKSGYS
LNFSEGDGRR		RRVLLRGRES		PAAGPRYSEE		GLSPSKRRRL		SMRNHHSDLT
FCEIILMEME		SHDAAWPFLE		PVNPRLVSGY		RRIIKNPMDF		STMRERLLRG
GYTSSEEFAA		DALLVFDNCQ		TFNEDDSEVG		KAGHIMRRFF		ESRWEEFYQG
KQANL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Jones M.H., Hamana N., Nezu J., Shimane M. (2000). A novel family of bromodomain genes. Genomics. 63: 40—45. PMID 10662543 DOI:10.1006/geno.1999.6071
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 12