BAZ2B

BAZ2B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E7O, 3G0L, 3Q2F, 4CUP, 4CUQ, 4CUR, 4CUS, 4CUT, 4CUU, 4IR3, 4IR4, 4IR5, 4IR6, 4NR9, 4NRA, 4NRB, 4NRC, 4QC1, 4QC3, 4QF3, 4RVR, 4XUA, 4XUB, 5CQ3, 5CQ4, 5CQ5, 5CQ6, 5CQ7, 5CQ8, 5CQA, 5CU8, 5CUA, 5CUB, 5CUC, 5CUD, 5CUE, 5CUG, 5E73, 5E74, 5E9Y, 5E9L, 5E9M, 5DYX, 5DYU, 5E9K, 5E9I
Ідентифікатори
Символи	BAZ2B, WALp4, bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B
Зовнішні ІД	OMIM: 605683 MGI: 2442782 HomoloGene: 8394 GeneCards: BAZ2B
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • ремоделювання хроматину • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29994	407823
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000026987
UniProt	Q9UIF8	A2AUY4
RefSeq (мРНК)	NM_001289975 NM_001329857 NM_001329858 NM_013450	NM_001001182
RefSeq (білок)	NP_001276904 NP_001316786 NP_001316787 NP_038478	NP_001001182
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 2: 59.9 – 60.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BAZ2B (англ. Bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 168 амінокислот, а молекулярна маса — 240 459.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESGERLPSS		AASSTTPTSS		STPSVASVVS		KGGLSTGVAS		LSSTINPCGH
LFRTAGDQPF		NLSTVSSAFP		MVSHPVFGLH		SASSGHSEFG		GLGTLGTPTA
LAAHPQLASF		PGAEWWRTTD		AHTRTGATFF		PPLLGIPPLF		APPAQNHDSS
SFHSRTSGKS		NRNGPEKGVN		GSINGSNTSS		VIGINTSVLS		TTASSSMGQT
KSTSSGGGNR		KCNQEQSKNQ		PLDARVDKIK		DKKPRKKAME		SSSNSDSDSG
TSSDTSSEGI		SSSDSDDLEE		DEEEEDQSIE		ESEDDDSDSE		SEAQHKSNNQ
VLLHGISDPK		ADGQKATEKA		QEKRIHQPLP		LASESQTHSF		QSQQKQPQVL
SQQLPFIFQS		SQAKEESVNK		HTSVIQSTGL		VSNVKPLSLV		NQAKKETYMK
LIVPSPDVLK		AGNKNTSEES		SLLTSELRSK		REQYKQAFPS		QLKKQESSKS
LKKVIAALSN		PKATSSSPAH		PKQTLENNHP		NPFLTNALLG		NHQPNGVIQS
VIQEAPLALT		TKTKMQSKIN		ENIAAASSTP		FSSPVNLSTS		GRRTPGNQTP
VMPSASPILH		SQGKEKAVSN		NVNPVKTQHH		SHPAKSLVEQ		FRGTDSDIPS
SKDSEDSNED		EEEDDEEEDE		EDDEDDESDD		SQSESDSNSE		SDTEGSEEED
DDDKDQDESD		SDTEGEKTSM		KLNKTTSSVK		SPSMSLTGHS		TPRNLHIAKA
PGSAPAALCS		ESQSPAFLGT		SSSTLTSSPH		SGTSKRRRVT		DERELRIPLE
YGWQRETRIR		NFGGRLQGEV		AYYAPCGKKL		RQYPEVIKYL		SRNGIMDISR
DNFSFSAKIR		VGDFYEARDG		PQGMQWCLLK		EEDVIPRIRA		MEGRRGRPPN
PDRQRAREES		RMRRRKGRPP		NVGNAEFLDN		ADAKLLRKLQ		AQEIARQAAQ
IKLLRKLQKQ		EQARVAKEAK		KQQAIMAAEE		KRKQKEQIKI		MKQQEKIKRI
QQIRMEKELR		AQQILEAKKK		KKEEAANAKL		LEAEKRIKEK		EMRRQQAVLL
KHQERERRRQ		HMMLMKAMEA		RKKAEEKERL		KQEKRDEKRL		NKERKLEQRR
LELEMAKELK		KPNEDMCLAD		QKPLPELPRI		PGLVLSGSTF		SDCLMVVQFL
RNFGKVLGFD		VNIDVPNLSV		LQEGLLNIGD		SMGEVQDLLV		RLLSAAVCDP
GLITGYKAKT		ALGEHLLNVG		VNRDNVSEIL		QIFMEAHCGQ		TELTESLKTK
AFQAHTPAQK		ASVLAFLINE		LACSKSVVSE		IDKNIDYMSN		LRRDKWVVEG
KLRKLRIIHA		KKTGKRDTSG		GIDLGEEQHP		LGTPTPGRKR		RRKGGDSDYD
DDDDDDSDDQ		GDEDDEDEED		KEDKKGKKTD		ICEDEDEGDQ		AASVEELEKQ
IEKLSKQQSQ		YRRKLFDASH		SLRSVMFGQD		RYRRRYWILP		QCGGIFVEGM
ESGEGLEEIA		KEREKLKKAE		SVQIKEEMFE		TSGDSLNCSN		TDHCEQKEDL
KEKDNTNLFL		QKPGSFSKLS		KLLEVAKMPP		ESEVMTPKPN		AGANGCTLSY
QNSGKHSLGS		VQSTATQSNV		EKADSNNLFN		TGSSGPGKFY		SPLPNDQLLK
TLTEKNRQWF		SLLPRTPCDD		TSLTHADMST		ASLVTPQSQP		PSKSPSPTPA
PLGSSAQNPV		GLNPFALSPL		QVKGGVSMMG		LQFCGWPTGV		VTSNIPFTSS
VPSLGSGLGL		SEGNGNSFLT		SNVASSKSES		PVPQNEKATS		AQPAAVEVAK
PVDFPSPKPI		PEEMQFGWWR		IIDPEDLKAL		LKVLHLRGIR		EKALQKQIQK
HLDYITQACL		KNKDVAIIEL		NENEENQVTR		DIVENWSVEE		QAMEMDLSVL
QQVEDLERRV		ASASLQVKGW		MCPEPASERE		DLVYFEHKSF		TKLCKEHDGE
FTGEDESSAH		ALERKSDNPL		DIAVTRLADL		ERNIERRIEE		DIAPGLRVWR
RALSEARSAA		QVALCIQQLQ		KSIAWEKSIM		KVYCQICRKG		DNEELLLLCD
GCDKGCHTYC		HRPKITTIPD		GDWFCPACIA		KASGQTLKIK		KLHVKGKKTN
ESKKGKKVTL		TGDTEDEDSA		STSSSLKRGN		KDLKKRKMEE		NTSINLSKQE
SFTSVKKPKR		DDSKDLALCS		MILTEMETHE		DAWPFLLPVN		LKLVPGYKKV
IKKPMDFSTI		REKLSSGQYP		NLETFALDVR		LVFDNCETFN		EDDSDIGRAG
HNMRKYFEKK		WTDTFKVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Jones M.H., Hamana N., Nezu J., Shimane M. (2000). A novel family of bromodomain genes. Genomics. 63: 40—45. PMID 10662543 DOI:10.1006/geno.1999.6071
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2