BPTF

BPTF
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2F6J, 2F6N, 2FSA, 2FUI, 2FUU, 2RI7, 3QZS, 3QZT, 3QZV, 3UV2
Ідентифікатори
Символи	BPTF, FAC1, FALZ, NURF301, bromodomain PHD finger transcription factor, NEDDFL
Зовнішні ІД	OMIM: 601819 MGI: 2444008 HomoloGene: 114397 GeneCards: BPTF
Пов'язані генетичні захворювання
рак легень, adenocarcinoma of the lung
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • methylated histone binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell body • Нуклеоплазма • дендрит (нейробіологія) • NURF complex • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • екзосома • клітинне ядро • Set1C/COMPASS complex Біологічний процес • Ремоделювання хроматину • cellular response to nerve growth factor stimulus • endoderm development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic placenta development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • brain development • response to wounding • anterior/posterior pattern specification • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2186	207165
Ensembl	ENSG00000171634	ENSMUSG00000040481
UniProt	Q12830	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_004459 NM_182641	NM_001080832 NM_176850 NM_001359590
RefSeq (білок)	NP_004450 NP_872579	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 67.83 – 67.98 Mb	Хр. 11: 106.92 – 107.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BPTF (англ. Bromodomain PHD finger transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 046 амінокислот, а молекулярна маса — 338 262.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRGRRGRPPK		QPAAPAAERC		APAPPPPPPP		PTSGPIGGLR		SRHRGSSRGR
WAAAQAEVAP		KTRLSSPRGG		SSSRRKPPPP		PPAPPSTSAP		GRGGRGGGGG
RTGGGGGGGH		LARTTAARRA		VNKVVYDDHE		SEEEEEEEDM		VSEEEEEEDG
DAEETQDSED		DEEDEMEEDD		DDSDYPEEME		DDDDDASYCT		ESSFRSHSTY
SSTPGRRKPR		VHRPRSPILE		EKDIPPLEFP		KSSEDLMVPN		EHIMNVIAIY
EVLRNFGTVL		RLSPFRFEDF		CAALVSQEQC		TLMAEMHVVL		LKAVLREEDT
SNTTFGPADL		KDSVNSTLYF		IDGMTWPEVL		RVYCESDKEY		HHVLPYQEAE
DYPYGPVENK		IKVLQFLVDQ		FLTTNIAREE		LMSEGVIQYD		DHCRVCHKLG
DLLCCETCSA		VYHLECVKPP		LEEVPEDEWQ		CEVCVAHKVP		GVTDCVAEIQ
KNKPYIRHEP		IGYDRSRRKY		WFLNRRLIIE		EDTENENEKK		IWYYSTKVQL
AELIDCLDKD		YWEAELCKIL		EEMREEIHRH		MDITEDLTNK		ARGSNKSFLA
AANEEILESI		RAKKGDIDNV		KSPEETEKDK		NETENDSKDA		EKNREEFEDQ
SLEKDSDDKT		PDDDPEQGKS		EEPTEVGDKG		NSVSANLGDN		TTNATSEETS
PSEGRSPVGC		LSETPDSSNM		AEKKVASELP		QDVPEEPNKT		CESSNTSATT
TSIQPNLENS		NSSSELNSSQ		SESAKAADDP		ENGERESHTP		VSIQEEIVGD
FKSEKSNGEL		SESPGAGKGA		SGSTRIITRL		RNPDSKLSQL		KSQQVAAAAH
EANKLFKEGK		EVLVVNSQGE		ISRLSTKKEV		IMKGNINNYF		KLGQEGKYRV
YHNQYSTNSF		ALNKHQHRED		HDKRRHLAHK		FCLTPAGEFK		WNGSVHGSKV
LTISTLRLTI		TQLENNIPSS		FLHPNWASHR		ANWIKAVQMC		SKPREFALAL
AILECAVKPV		VMLPIWRESL		GHTRLHRMTS		IEREEKEKVK		KKEKKQEEEE
TMQQATWVKY		TFPVKHQVWK		QKGEEYRVTG		YGGWSWISKT		HVYRFVPKLP
GNTNVNYRKS		LEGTKNNMDE		NMDESDKRKC		SRSPKKIKIE		PDSEKDEVKG
SDAAKGADQN		EMDISKITEK		KDQDVKELLD		SDSDKPCKEE		PMEVDDDMKT
ESHVNCQESS		QVDVVNVSEG		FHLRTSYKKK		TKSSKLDGLL		ERRIKQFTLE
EKQRLEKIKL		EGGIKGIGKT		STNSSKNLSE		SPVITKAKEG		CQSDSMRQEQ
SPNANNDQPE		DLIQGCSESD		SSVLRMSDPS		HTTNKLYPKD		RVLDDVSIRS
PETKCPKQNS		IENDIEEKVS		DLASRGQEPS		KSKTKGNDFF		IDDSKLASAD
DIGTLICKNK		KPLIQEESDT		IVSSSKSALH		SSVPKSTNDR		DATPLSRAMD
FEGKLGCDSE		SNSTLENSSD		TVSIQDSSEE		DMIVQNSNES		ISEQFRTREQ
DVEVLEPLKC		ELVSGESTGN		CEDRLPVKGT		EANGKKPSQQ		KKLEERPVNK
CSDQIKLKNT		TDKKNNENRE		SEKKGQRTST		FQINGKDNKP		KIYLKGECLK
EISESRVVSG		NVEPKVNNIN		KIIPENDIKS		LTVKESAIRP		FINGDVIMED
FNERNSSETK		SHLLSSSDAE		GNYRDSLETL		PSTKESDSTQ		TTTPSASCPE
SNSVNQVEDM		EIETSEVKKV		TSSPITSEEE		SNLSNDFIDE		NGLPINKNEN
VNGESKRKTV		ITEVTTMTST		VATESKTVIK		VEKGDKQTVV		SSTENCAKST
VTTTTTTVTK		LSTPSTGGSV		DIISVKEQSK		TVVTTTVTDS		LTTTGGTLVT
SMTVSKEYST		RDKVKLMKFS		RPKKTRSGTA		LPSYRKFVTK		SSKKSIFVLP
NDDLKKLARK		GGIREVPYFN		YNAKPALDIW		PYPSPRPTFG		ITWRYRLQTV
KSLAGVSLML		RLLWASLRWD		DMAAKAPPGG		GTTRTETSET		EITTTEIIKR
RDVGPYGIRS		EYCIRKIICP		IGVPETPKET		PTPQRKGLRS		SALRPKRPET
PKQTGPVIIE		TWVAEEELEL		WEIRAFAERV		EKEKAQAVEQ		QAKKRLEQQK
PTVIATSTTS		PTSSTTSTIS		PAQKVMVAPI		SGSVTTGTKM		VLTTKVGSPA
TVTFQQNKNF		HQTFATWVKQ		GQSNSGVVQV		QQKVLGIIPS		STGTSQQTFT
SFQPRTATVT		IRPNTSGSGG		TTSNSQVITG		PQIRPGMTVI		RTPLQQSTLG
KAIIRTPVMV		QPGAPQQVMT		QIIRGQPVST		AVSAPNTVSS		TPGQKSLTSA
TSTSNIQSSA		SQPPRPQQGQ		VKLTMAQLTQ		LTQGHGGNQG		LTVVIQGQGQ
TTGQLQLIPQ		GVTVLPGPGQ		QLMQAAMPNG		TVQRFLFTPL		ATTATTASTT
TTTVSTTAAG		TGEQRQSKLS		PQMQVHQDKT		LPPAQSSSVG		PAEAQPQTAQ
PSAQPQPQTQ		PQSPAQPEVQ		TQPEVQTQTT		VSSHVPSEAQ		PTHAQSSKPQ
VAAQSQPQSN		VQGQSPVRVQ		SPSQTRIRPS		TPSQLSPGQQ		SQVQTTTSQP
IPIQPHTSLQ		IPSQGQPQSQ		PQVQSSTQTL		SSGQTLNQVT		VSSPSRPQLQ
IQQPQPQVIA		VPQLQQQVQV		LSQIQSQVVA		QIQAQQSGVP		QQIKLQLPIQ
IQQSSAVQTH		QIQNVVTVQA		ASVQEQLQRV		QQLRDQQQKK		KQQQIEIKRE
HTLQASNQSE		IIQKQVVMKH		NAVIEHLKQK		KSMTPAEREE		NQRMIVCNQV
MKYILDKIDK		EEKQAAKKRK		REESVEQKRS		KQNATKLSAL		LFKHKEQLRA
EILKKRALLD		KDLQIEVQEE		LKRDLKIKKE		KDLMQLAQAT		AVAAPCPPVT
PAPPAPPAPP		PSPPPPPAVQ		HTGLLSTPTL		PAASQKRKRE		EEKDSSSKSK
KKKMISTTSK		ETKKDTKLYC		ICKTPYDESK		FYIGCDRCQN		WYHGRCVGIL
QSEAELIDEY		VCPQCQSTED		AMTVLTPLTE		KDYEGLKRVL		RSLQAHKMAW
PFLEPVDPND		APDYYGVIKE		PMDLATMEER		VQRRYYEKLT		EFVADMTKIF
DNCRYYNPSD		SPFYQCAEVL		ESFFVQKLKG		FKASRSHNNK		LQSTAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Jones M.H., Hamana N., Shimane M. (2000). Identification and characterization of BPTF, a novel bromodomain transcription factor. Genomics. 63: 35—39. PMID 10662542 DOI:10.1006/geno.1999.6070
• Bowser R., Giambrone A., Davies P. (1995). FAC1, a novel gene identified with the monoclonal antibody Alz50, is developmentally regulated in human brain. Dev. Neurosci. 17: 20—37. PMID 7621746 DOI:10.1159/000111270
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mu X., Springer J.E., Bowser R. (1997). FAC1 expression and localization in motor neurons of developing, adult, and amyotrophic lateral sclerosis spinal cord. Exp. Neurol. 146: 17—24. PMID 9225734 DOI:10.1006/exnr.1997.6508
• Jordan-Sciutto K.L., Dragich J.M., Bowser R. (1999). DNA binding activity of the fetal Alz-50 clone 1 (FAC1) protein is enhanced by phosphorylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 260: 785—789. PMID 10403843 DOI:10.1006/bbrc.1999.0986
• Jordan-Sciutto K.L., Dragich J.M., Rhodes J.L., Bowser R. (1999). Fetal Alz-50 clone 1, a novel zinc finger protein, binds a specific DNA sequence and acts as a transcriptional regulator. J. Biol. Chem. 274: 35262—35268. PMID 10575013 DOI:10.1074/jbc.274.49.35262

Див. також

• Хромосома 17