BRF2

BRF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ROD, 4ROE, 4ROC
Ідентифікатори
Символи	BRF2, BRFU, TFIIIB50, RNA polymerase III transcription initiation factor 50 kDa subunit, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, BRF2 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 607013 MGI: 1913903 HomoloGene: 10127 GeneCards: BRF2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding • transcription factor binding Клітинна компонента • клітинне ядро • Нуклеоплазма • transcription factor TFIIIB complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • regulation of transcription by RNA polymerase III • cellular response to oxidative stress • transcription preinitiation complex assembly • DNA-templated transcription, initiation • RNA polymerase III preinitiation complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55290	66653
Ensembl	ENSG00000104221	ENSMUSG00000031487
UniProt	Q9HAW0	Q3UAW9
RefSeq (мРНК)	NM_018310	NM_025686
RefSeq (білок)	NP_060780	NP_079962
Локус (UCSC)	Хр. 8: 37.84 – 37.85 Mb	Хр. 8: 27.61 – 27.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BRF2 (англ. BRF2, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 46 533.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGRGRCPDC		GSTELVEDSH		YSQSQLVCSD		CGCVVTEGVL		TTTFSDEGNL
REVTYSRSTG		ENEQVSRSQQ		RGLRRVRDLC		RVLQLPPTFE		DTAVAYYQQA
YRHSGIRAAR		LQKKEVLVGC		CVLITCRQHN		WPLTMGAICT		LLYADLDVFS
STYMQIVKLL		GLDVPSLCLA		ELVKTYCSSF		KLFQASPSVP		AKYVEDKEKM
LSRTMQLVEL		ANETWLVTGR		HPLPVITAAT		FLAWQSLQPA		DRLSCSLARF
CKLANVDLPY		PASSRLQELL		AVLLRMAEQL		AWLRVLRLDK		RSVVKHIGDL
LQHRQSLVRS		AFRDGTAEVE		TREKEPPGWG		QGQGEGEVGN		NSLGLPQGKR
PASPALLLPP		CMLKSPKRIC		PVPPVSTVTG		DENISDSEIE		QYLRTPQEVR
DFQRAQAARQ		AATSVPNPP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Schramm L., Pendergrast P.S., Sun Y., Hernandez N. (2000). Different human TFIIIB activities direct RNA polymerase III transcription from TATA-containing and TATA-less promoters. Genes Dev. 14: 2650—2663. PMID 11040218 DOI:10.1101/gad.836400
• Teichmann M., Wang Z., Roeder R.G. (2000). A stable complex of a novel transcription factor IIB- related factor, human TFIIIB50, and associated proteins mediate selective transcription by RNA polymerase III of genes with upstream promoter elements. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 14200—14205. PMID 11121026 DOI:10.1073/pnas.97.26.14200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cabart P., Murphy S. (2001). BRFU, a TFIIB-like factor, is directly recruited to the TATA-box of polymerase III small nuclear RNA gene promoters through its interaction with TATA-binding protein. J. Biol. Chem. 276: 43056—43064. PMID 11564744 DOI:10.1074/jbc.M108515200
• Cabart P., Murphy S. (2002). Assembly of human small nuclear RNA gene-specific transcription factor IIIB complex de novo on and off promoter. J. Biol. Chem. 277: 26831—26838. PMID 12016223 DOI:10.1074/jbc.M203119200
• Ma B., Hernandez N. (2002). Redundant cooperative interactions for assembly of a human U6 transcription initiation complex. Mol. Cell. Biol. 22: 8067—8078. PMID 12391172 DOI:10.1128/MCB.22.22.8067-8078.2002

Див. також

• Хромосома 8