BTRC

BTRC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P22, 2P64
Ідентифікатори
Символи	BTRC, BETA-TRCP, FBW1A, FBXW1, FBXW1A, FWD1, bTrCP, bTrCP1, betaTrCP, beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 603482 MGI: 1338871 HomoloGene: 39330 GeneCards: BTRC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ligase activity • protein phosphorylated amino acid binding • protein dimerization activity • beta-catenin binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • snoRNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма • SCF ubiquitin ligase complex • small-subunit processome • Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome Біологічний процес • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • protein destabilization • regulation of cell cycle • GO:0044257 protein catabolic process • G2/M transition of mitotic cell cycle • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • stress-activated MAPK cascade • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of proteolysis • regulation of proteasomal protein catabolic process • regulation of circadian rhythm • mammary gland epithelial cell proliferation • branching involved in mammary gland duct morphogenesis • negative regulation of smoothened signaling pathway • ритмічний процес • NIK/NF-kappaB signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0016576 protein dephosphorylation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of circadian rhythm • Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • GO:0022415 viral process • посттрансляційна модифікація • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • regulation of mitotic cell cycle phase transition • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • T cell receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8945	12234
Ensembl	ENSG00000166167	ENSMUSG00000025217
UniProt	Q9Y297 Q5T1W7	Q3ULA2
RefSeq (мРНК)	NM_001256856 NM_003939 NM_033637	NM_001037758 NM_001286465 NM_001286466 NM_009771 NM_001360120 NM_001360122 NM_001360124 NM_001360126 NM_001360127
RefSeq (білок)	NP_001243785 NP_003930 NP_378663	NP_001032847 NP_001273394 NP_001273395 NP_033901 NP_001347049 NP_001347051 NP_001347053 NP_001347055 NP_001347056
Локус (UCSC)	Хр. 10: 101.35 – 101.56 Mb	Хр. 19: 45.35 – 45.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BTRC (англ. Beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 605 амінокислот, а молекулярна маса — 68 867.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPAEAVLQE		KALKFMCSMP		RSLWLGCSSL		ADSMPSLRCL		YNPGTGALTA
FQNSSEREDC		NNGEPPRKII		PEKNSLRQTY		NSCARLCLNQ		ETVCLASTAM
KTENCVAKTK		LANGTSSMIV		PKQRKLSASY		EKEKELCVKY		FEQWSESDQV
EFVEHLISQM		CHYQHGHINS		YLKPMLQRDF		ITALPARGLD		HIAENILSYL
DAKSLCAAEL		VCKEWYRVTS		DGMLWKKLIE		RMVRTDSLWR		GLAERRGWGQ
YLFKNKPPDG		NAPPNSFYRA		LYPKIIQDIE		TIESNWRCGR		HSLQRIHCRS
ETSKGVYCLQ		YDDQKIVSGL		RDNTIKIWDK		NTLECKRILT		GHTGSVLCLQ
YDERVIITGS		SDSTVRVWDV		NTGEMLNTLI		HHCEAVLHLR		FNNGMMVTCS
KDRSIAVWDM		ASPTDITLRR		VLVGHRAAVN		VVDFDDKYIV		SASGDRTIKV
WNTSTCEFVR		TLNGHKRGIA		CLQYRDRLVV		SGSSDNTIRL		WDIECGACLR
VLEGHEELVR		CIRFDNKRIV		SGAYDGKIKV		WDLVAALDPR		APAGTLCLRT
LVEHSGRVFR		LQFDEFQIVS		SSHDDTILIW		DFLNDPAAQA		EPPRSPSRTY
TYISR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, біологічні ритми, убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shirane M., Hatakeyama S., Hattori K., Nakayama K., Nakayama K. (1999). Common pathway for the ubiquitination of IkappaBalpha, IkappaBbeta, and IkappaBepsilon mediated by the F-box protein FWD1. J. Biol. Chem. 274: 28169—28174. PMID 10497169 DOI:10.1074/jbc.274.40.28169
• Fong A., Sun S.C. (2002). Genetic evidence for the essential role of beta-transducin repeat-containing protein in the inducible processing of NF-kappa B2/p100. J. Biol. Chem. 277: 22111—22114. PMID 11994270 DOI:10.1074/jbc.C200151200
• Semplici F., Meggio F., Pinna L.A., Oliviero S. (2002). CK2-dependent phosphorylation of the E2 ubiquitin conjugating enzyme UBC3B induces its interaction with beta-TrCP and enhances beta-catenin degradation. Oncogene. 21: 3978—3987. PMID 12037680 DOI:10.1038/sj.onc.1205574
• Mantovani F., Banks L. (2003). Regulation of the discs large tumor suppressor by a phosphorylation-dependent interaction with the beta-TrCP ubiquitin ligase receptor. J. Biol. Chem. 278: 42477—42486. PMID 12902344 DOI:10.1074/jbc.M302799200
• Yook J.I., Li X.Y., Ota I., Fearon E.R., Weiss S.J. (2005). Wnt-dependent regulation of the E-cadherin repressor snail. J. Biol. Chem. 280: 11740—11748. PMID 15647282 DOI:10.1074/jbc.M413878200

Див. також

• Хромосома 10