C7orf49

C7orf49
Ідентифікатори
Символи	CYREN, MRI, chromosome 7 open reading frame 49, MRI-2, C7orf49, cell cycle regulator of NHEJ
Зовнішні ІД	OMIM: 616980 MGI: 1925662 HomoloGene: 49745 GeneCards: CYREN
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	78996	78412
Ensembl	ENSG00000122783	ENSMUSG00000046806
UniProt	Q9BWK5	Q8BHZ5
RefSeq (мРНК)	NM_024033 NM_001243749 NM_001243751 NM_001243752 NM_001243753 NM_001243754 NM_001243755 NM_001305629 NM_001305630 NM_001363329 NM_001363330	NM_001135611 NM_199145 NM_001347101
RefSeq (білок)	NP_001230678 NP_001230680 NP_001230681 NP_001230682 NP_001230683 NP_001230684 NP_001292558 NP_001292559 NP_076938 NP_001350258 NP_001350259	NP_001129083 NP_001334030 NP_954596
Локус (UCSC)	Хр. 7: 135.09 – 135.17 Mb	Хр. 6: 34.85 – 34.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C7orf49 (англ. Chromosome 7 open reading frame 49) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 157 амінокислот, а молекулярна маса — 16 829.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
METLQSETKT		RVLPSWLTAQ		VATKNVAPMK		APKRMRMAAV		PVAAARLPAT
RTVYCMNEAE		IVDVALGILI		ESRKQEKACE		QPALAGADNP		EHSPPCSVSP
HTSSGSSSEE		EDSGKQALAP		GLSPSQRPGG		SSSACSRSPE		EEEEEDVLKY
VREIFFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Slavoff S.A., Heo J., Budnik B.A., Hanakahi L.A., Saghatelian A. (2014). A human short open reading frame (sORF)-encoded polypeptide that stimulates DNA end joining. J. Biol. Chem. 289: 10950—10957. PMID 24610814 DOI:10.1074/jbc.C113.533968

Див. також

• Хромосома 7