CALCOCO1

CALCOCO1
Ідентифікатори
Символи	CALCOCO1, Cocoa, calphoglin, PP13275, calcium binding and coiled-coil domain 1
Зовнішні ІД	MGI: 1914738 HomoloGene: 10845 GeneCards: CALCOCO1
Пов'язані генетичні захворювання
панічний розлад
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor coactivator activity • armadillo repeat domain binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • intracellular steroid hormone receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901313 positive regulation of gene expression Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57658	67488
Ensembl	ENSG00000012822	ENSMUSG00000023055
UniProt	Q9P1Z2	Q8CGU1
RefSeq (мРНК)	NM_001143682 NM_020898	NM_026192
RefSeq (білок)	NP_001137154 NP_065949	NP_080468
Локус (UCSC)	Хр. 12: 53.71 – 53.73 Mb	Хр. 15: 102.62 – 102.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CALCOCO1 (англ. Calcium binding and coiled-coil domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 691 амінокислот, а молекулярна маса — 77 336.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEESPLSRAP		SRGGVNFLNV		ARTYIPNTKV		ECHYTLPPGT		MPSASDWIGI
FKVEAACVRD		YHTFVWSSVP		ESTTDGSPIH		TSVQFQASYL		PKPGAQLYQF
RYVNRQGQVC		GQSPPFQFRE		PRPMDELVTL		EEADGGSDIL		LVVPKATVLQ
NQLDESQQER		NDLMQLKLQL		EGQVTELRSR		VQELERALAT		ARQEHTELME
QYKGISRSHG		EITEERDILS		RQQGDHVARI		LELEDDIQTI		SEKVLTKEVE
LDRLRDTVKA		LTREQEKLLG		QLKEVQADKE		QSEAELQVAQ		QENHHLNLDL
KEAKSWQEEQ		SAQAQRLKDK		VAQMKDTLGQ		AQQRVAELEP		LKEQLRGAQE
LAASSQQKAT		LLGEELASAA		AARDRTIAEL		HRSRLEVAEV		NGRLAELGLH
LKEEKCQWSK		ERAGLLQSVE		AEKDKILKLS		AEILRLEKAV		QEERTQNQVF
KTELAREKDS		SLVQLSESKR		ELTELRSALR		VLQKEKEQLQ		EEKQELLEYM
RKLEARLEKV		ADEKWNEDAT		TEDEEAAVGL		SCPAALTDSE		DESPEDMRLP
PYGLCERGDP		GSSPAGPREA		SPLVVISQPA		PISPHLSGPA		EDSSSDSEAE
DEKSVLMAAV		QSGGEEANLL		LPELGSAFYD		MASGFTVGTL		SETSTGGPAT
PTWKECPICK		ERFPAESDKD		ALEDHMDGHF		FFSTQDPFTF		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takahashi K., Inuzuka M., Ingi T. (2004). Cellular signaling mediated by calphoglin-induced activation of IPP and PGM. Biochem. Biophys. Res. Commun. 325: 203—214. DOI:10.1016/J.BBRC.2004.10.021

Див. також

• Хромосома 12